促性腺激素释放激素(gonadotropin-releasing hormone,GnRH)由动物丘脑分泌。研究表明,禽类GnRH表达量的高低与家禽的繁殖性能具有密切的相关性,GnRH可作为与产蛋性能相关的候选基因之一。本研究以我国优良的中型鹅品种皖西白鹅(n=200)和引入的莱茵鹅(n=80)为研究素材,选择与产蛋性能相关的GnRH基因,通过比较基因组学方法,应用Dnastar和PrimerPremier 5.0软件,根据GenBank登陆的鸡GnRH基因序列(登陆号:x69491),共设计了4对引物对皖西白鹅GnRH基因的5’端调控区及外显子1序列进行克隆测序;运用PCR-SSCP法对皖西白鹅和莱茵鹅GnRH基因外显子1和5’端调控区片段分别进行多态性分析,检测其基因突变位点,并分析基因多态性及与皖西白鹅产蛋量间的相关性。克隆了皖西白鹅和莱茵克GnRH基因5’端调控区及外显子1序列(GenBank登录号:EF495207,EF405623)。序列比较表明,皖西白鹅GnRH基因5’端调控区序列与莱茵鹅和家鸡的同源性分别为99%和65%;外显子1序列与莱茵鹅和家鸡序列完全相同。对皖西白鹅和莱茵鹅GnRH基因5’调控区及外显子1进行多态性检测,结果表明,外显子1扩增片段经SSCP检测不存在多态性;5’端调控区发现有3个SNP位点,其中GnRH基因5’调控区F3引物有2个SNP位点,而F4引物有1个SNP位点。群体遗传学分析表明,皖西白鹅F3引物检测的两个等位基因,频率分别为0.7和0.3,三种基因型(AA、AB和BB)频率分别为0.62、0.16和0.22;F4引物检测的两个等位基因频率分别为0.83和0.17,三种基因型(CC、CD和DD)频率分别为0.66、0.34和0。经X~2适合性检验,群体在两位点均处于Hardy-Weinberg不平衡状态。莱茵鹅F3和F4引物检测的等位基因频率分别为0.625、0.375和0.575、0.425,对应的基因型(EE、EF、FF、MM、MN和MM)频率分别为0.525、0.2、0.275、0.4、0.35和0.25。经X~2检验,两位点均处于Hardy-Weinberg不平衡状态。皖西白鹅在F3和F4引物检测的多态位点的PIC分别为0.3381和0.2424;莱茵鹅在F3和F4引物检测位点的PIC分别为0.3589和0.3693。最小二乘分析表明,在皖西白鹅群体中,F3引物检测出的三种基因型与产蛋量间有显著相关性(P＜0.05),BB基因型产蛋量明显高于AA和AB型(P＜0.05)。莱茵鹅群体F3引物的三种基因型与产蛋量也有显著差异(P＜0.05),FF基因型的产蛋量明显低于EE和EF型(p＜0.05),本位点可作为产蛋性状的分子标记。