两种禾谷孢囊线虫致病型相关分子标记的建立

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禾谷孢囊线虫是危害温带禾谷类作物的重要病原线虫,严重影响禾谷类作物的产量和质量,该病害症状与黄矮病、施肥不均、缺肥、缺素等生理性病害的症状十分相似,以前经常被忽略,现在已经确认在我国16个省(自治区、直辖市)均有禾谷孢囊线虫病害的发生并产生危害,严重威胁我国的粮食安全,并且有不断加速蔓延的趋势。经过多年研究表明选育和种植抗病品种是防控该病害最为经济有效的措施,而禾谷孢囊线虫致病型的鉴定对于抗病品种的选育和利用具有重要的意义。传统的致病型鉴定工序繁杂,费工费时,且鉴定结果极易受外界条件影响,因此亟需创建一套快速分子检测体系,缩短致病型鉴定的周期,提高鉴定的准确率。本研究主要针对黄淮麦区5个重要禾谷孢囊线虫致病型共9个线虫群体进行RAPD和ISSR分析,旨在建立一套快速、简便、准确的分子检测体系。这9个群体为:荥阳、保定、商丘、安阳、清丰、杞县、许昌、淮阳、博爱群体。另外在进行SCAR标记特异性检测时又增加8个群体:邯郸、扎兰屯、克什克腾、菏泽、高唐、上马、灵璧、萧县群体。主要研究内容和结果如下:共筛选了 RAPD随机引物331条,找到了 4个燕麦孢囊线虫荥阳群体致病型的相关RAPD标记:引物S10可以扩增出一条约750bp的多态性片段,引物S43可以扩增出一条约1200bp的多态性片段,引物S112可以扩增出一条800bp的多态性片段,引物S170可以扩增出一条约1300bp的多态性片段,;1个燕麦孢囊线虫保定、商丘群体致病型相关的RAPD标记:引物S83可以扩增出一条约350bp的多态性片段;2个菲利普孢囊线虫许昌群体致病型相关的RAPD标记:引物S86可以扩增出一条约550bp的多态性片段,引物S178可以扩增出一条约1200bp的多态性片段;3个菲利普孢囊线虫淮阳、博爱群体致病型相关的RAPD标记:引物S48可以扩增出一条约600bp的多态性片段,引物S232可以扩增出1条约550bp的多态性片段,引物S278可以扩增出一条1700bp的多态性片段。其中荥阳群体致病型的3个RAPD标记和许昌群体致病型的其中2个RAPD标记已成功转化为SCAR标记,对多态性片段进行割胶冋收后克隆测序,引物S10扩增出的多态性片段大小为759bp,引物S43扩增出的多态性片段大小为1182bp,引物S112扩增出的多态性片段大小为857bp,引物S86扩增出的多态性片段大小为539bp,引物S178扩增出的多态性片段大小为1135bp。根据测序结果设计特异性引物,运用PCR技术进行特异性检测,结果表明根据S10、S43、SU2扩增的多态性片段设计的特异性引物进行扩增只有荥阳群体能够扩增出特异性条带,根据S86、S178扩增的多态性片段设计的特异性引物进行扩增只有许昌群体能够扩增出特异性条带,证明这5个SCAR标记具有特异性,可以用于荥阳群体和许昌群体致病型的分子检测。ISSR引物共筛选了 57条引物,找到了燕麦孢囊线虫荥阳群体致病型3个ISSR标记,引物UBC810可以扩增出一条约1900bp的多态性条带,引物UBC811可以扩增出一条约1400bp的特异性条带,引物UBC813可以扩增出一条1800bp的特异性条带。其中引物UBC810扩增出的特异性条带已成功转化成SCAR标记,测序结果显示片段大小为1757bp,设计特异性引物进行PCR扩增只有荥阳群体能够扩增出特异性条带,证明该SCAR标记具有特异性,可以用于荥阳群体致病型的分子检测。
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