负密度制约和生境过滤是解释森林群落物种共存和生物多样性的重要假说。负密度制约假定优势物种及其亲缘种之间的竞争、个体间病菌传播等过程为非优势物种提供生存空间；生境过滤指的是生境对具有适应该生境相似性状的一类物种进行选择而对其它物种进行淘汰的过程。前人的研究主要集中于利用负密度制约和生境过滤来解释物种多样性的空间变化格局，本研究则是利用这两个机制来解释在时间序列上群落系统发育多样性和功能多样性的格局变化。近年来结合物种的系统发育结构，生态学家们在物种多样性的基础上提出了系统发育多样性。系统发育结构的引入使得物种不是简单的划分为同种或异种，而是结合了物种进化上的关系。但是生态位在进化过程不保守的情况下，物种间的功能性状差异与亲缘关系并不相关。因此将系统发育多样性和功能多样性结合起来进行研究能够更好的理解维持群落多样性的机制。本文通过研究古田山24公顷样地中的幼苗（胸径<1cm）变化动态，利用2006年和2007年古田山样地内342个幼苗样方内的幼苗监测数据，分析位于不同生境内幼苗的的系统发育α多样性和系统发育β多样性随时间变化的格局。我们发现：随着时间的变化，位于同一生境的样方幼苗系统发育α多样性显著增加；而幼苗系统发育β多样性在同一生境内显著降低。结果表明：在亚热带森林群落中，负密度制约效应和生境过滤共同作用来维持群落的多样性。本文同时还研究了负密度制约和生境过滤对古田山幼苗功能多样性的影响。利用2006年和2007年的五种幼苗功能性状数据，即木质密度、气孔密度、比叶面积、叶片氮含量和叶片磷含量，分析幼苗功能多样性随着时间变化的趋势。结果表明：随着时间的变化，木质密度、比叶面积、叶片氮含量和叶片磷含量的α多样性显著增加，而气孔密度α多样性变化不显著；用平均最近功能性状距离（Dnn）表示的木质密度β多样性、气孔密度β多样性、比叶面积β多样性和叶片磷含量β多样性随着时间的推移均呈下降趋势，叶片氮含量β多样性变化趋势不明显，而用平均成对功能性状距离表示的功能β多样性均呈上升趋势。这个结果表明：负密度制约能够促进群落的功能α多样性，生境过滤能够在一定程度上影响群落的功能β多样性。