拟南芥、水稻和杨树ACTIN家族全基因组分析

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肌动蛋白(ACTIN)家族是一个在动植物中广泛存在的基因家族。这个家族成员众多并且在动植物的生长发育过程中起到十分重要的调控作用。但目前,这个家族成员的功能在植物中的研究还比较少。近年来,拟南芥、水稻和杨树的全基因组测序工作的完成,为从基因组水平研究和比较开花植物的ACTIN基因家族提供了坚实的基础。通过数据库搜索和分析,在拟南芥、水稻和杨树三种植物基因组中找到了60个可能的ACTIN基因家族成员。系统发生分析表明,这些ACTIN基因可以依据支持度划分成多个亚家族。同时,多项信息学分析的结果初步揭示了这个家族的成员在进化和功能上的相关性。ACTIN家族成员在水稻和拟南芥基因组上的分布和复制(Duplication)分析也为染色体区域复制的理论提供了有力证据。此外,对拟南芥、水稻和杨树中ACTIN成员所做的系统发生分析表明,ACTIN基因含有的共同的祖先。这一分析也支持了基因家族进化的“发生和消亡”理论。本研究有助于揭示植物ACTIN基因家族的进化历史,为后续ACTIN基因家族的功能提供线索,对研究植物ACTIN基因家族功能和进化上的多样性提供理论基础。
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