基于光微流激光的DNA-HRM分析及应用

来源 :太原理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xdhjyinghua
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
基因是决定生物性状的根本性因素,基因片段中的DNA通过转录翻译等过程从而控制生物性状的表达,DNA中的碱基序列发生变异会导致非常严重的后果。研究表明许多可遗传疾病都与DNA序列中的单碱基变异有着直接关系,因此从DNA层面检测DNA序列中是否存在碱基变异可以更快、更及时、更准确地检查出一些疾病。本课题主要以法布里-珀罗(FP)腔为检测基础,分析研究基于高品质因子光微流激光腔的高分辨率熔解曲线(HRM),本文工作中主要分析了三种类型的DNA,分别是:(1)99个碱基对和两种GC含量的130个碱基对的单碱基破坏型DNA序列:(2)四种单核苷酸多态性(SNP)变异DNA以及与实际疾病有关的三种SNP变异DNA;(3)富含G碱基的单链DNA。具体如下:1.理论分析并模拟了基于光微流激光的DNA-HRM,分析基于激光的HRM与基于荧光的HRM异同。随后通过实验分析研究了99个碱基对以及两种类型的130个碱基对的DNA序列,实验结果表明99个碱基对的DNA序列,完全配对(Target)与其单碱基错配(Mismatch)DNA之间的裂解温差为0.9至1℃,而对于130个碱基DNA(Type I)为0.7-0.8℃,130碱基DNA(Type II)约为0.5℃。并且,通过调节出射激光的参数使得基于激光的HRM相比于基于荧光的HRM裂解温度降低10℃以上。另外因为激光的独特性质,可以在保持温度不变的基础上,扫描激光出射强度与外界泵浦强度之间的关系,根据斜率等结果的不同可以快速分辨Target和Mismatch DNA,这是基于荧光的HRM所不能实现的。2.因为SNP变异的DNA变异前与变异后的热动力学差别更小,运用固定温度下扫描方法分析SNP变异DNA。首先检测分析自由设计的四种SNP变异,固定温度下的扫描方法可以很好的区分它们之间的变化。然后,分析人类可遗传疾病中三种最常见的SNP变异疾病:MTHFR(亚甲基四氢叶酸还原酶)、Factor V(V因子)、Β-globin(珠蛋白基因),同样实现了在较低的温度下,通过固定温度扫描法区分出变异前后的DNA。3.基于FP腔分析了富含G碱基的单链DNA在外界金属阳离子的诱导下形成G-四链体(G-quadruplex)并发生腔内荧光共振能量转移(FRET)现象。随着温度的变化,基于激光的FRET的受体信号强度变化相比于基于荧光的FRET更加明显。
其他文献
今年寒假,找一如往常为了音乐奔波着,我何其幸运在神秘的埃及首都开罗举办了独奏音乐会,又和来自其他国家的青年钢琴家们一起参加了在乌克兰基辅举办的音乐节及演出。看到这两个
制造业的生产加工活动是以市场需求为导向的,而现今的市场需求又是随着时间不断改变的,以致一些制造企业在不同生产周期内的加工任务有所不同。因此传统的车间设施布局在应对
【摘 要】 现代教育技术在教学中的运用是跨时代的改变,其在教学中的运用越来越广泛,它发挥的作用不容小觑,把师生从传统教学模式中脱身出来,为学习者提供了充足的学习资源,使学生和老师打破时空的限制,可以随时随地学习、交流。现代教育技术发挥其优势的同时,课堂具体实施的过程中仍然面临着很多问题。  【关键词】 现代教育技术;存在问题;解决措施  【中图分类号】G64.23 【文献标识码】A 【文章编号】2
【摘 要】 当前,党校图书馆传统的服务模式正受到信息化、网络化的严重冲击,存在着被边缘化的危险,如何提供创新服务成为摆在各级党校图书馆面前的重要课题。本文主要从馆藏、人才和制度、技术、内容几方面探讨了党校图书馆创新服务的实现路径。  【关键词】 党校图书馆;创新服务;路径  【中图分类号】G63.24 【文献标识码】A 【文章编号】2095-3089(2015)20-000-01  基于当前党校图
21世纪是一个全球竞争日益加剧的年代,伴随着全球经济一体化的浪潮,新的产业集聚原理对于经济发展的重大意义日益得到国内外学界、商界和政界的空前重视。在分析集群发展的研
提出利用1+2维小波变换技术对多光谱遥感图像进行近无损压缩.使用嵌入式块截断算法压缩谱内图像;谱间变换使用短滤波器进行1维小波变换,去除多光谱图像的谱间冗余.实验证明,
我们经常能在杂锦类的乐谱封面见到一个熟悉的名字——威尔,但是很少有人会特意关注这位编者。笔者在音乐学院求学的几年中,借阆了多本乐谱,也频繁地发现由他汇编的乐谱,于是好奇
<正>由中国教育学会主办,中国教育学会音乐教育分会、《钢琴艺术》编辑部和苏州大学三家承办的"‘海伦钢琴’第三届全国高校音乐学(教师教育)钢琴专业教师演奏邀请赛",于2011
【摘要】美国尤金.A.奈达的“功能对等”翻译理论是受中国翻译理论研究者非常推崇的众多西方翻译理论之一,本文通过对其主要理论的简析,以求在今后翻译实践中正确运用这一理论。  【关键词】翻译理论 奈达 功能对等  【中图分类号】G642.0 【文献标识码】A 【文章编号】2095-3089(2015)18-0049-02  一、功能对等理论简介  尤金 A 奈达是美国著名的语言学家,翻译家和翻译理论家
由中央音乐学院主办的"第一届北京肖邦国际青少年钢琴比赛"于2016年10月16日至30日在北京举行,比赛全程在新近落成的中央音乐学院歌剧音乐厅进行。此次在京举行的这项赛事是唯