基于深度学习的实体肿瘤分割分类模型研究

来源 :陕西师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhangyong131420
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
癌症是一种危重疾病,对于大部分实体肿瘤,上皮组织区域是癌症的原始病发区。病理学家诊断、风险因素评估及组织形态学分析的方法都始于上皮组织区域。自动检测及分析上皮组织区域中细胞核的形态,有助于病理学家对病情的诊断及对预后进行深入评估。肿瘤的分类与病患的诊疗策略及预后息息相关,在传统的病理诊断中,病理专家通常利用肉眼观察来捕获这些类别信息,其工作量大、检测周期长,而且不同专家得出的结果也存在差异。自动的肿瘤级别的分类,可以作为第二阅读者,为病理学家提供客观的辅助信息,减轻工作量,提高准确率。目前,大部分肿瘤区域的自动分割、分类的研究多基于传统“手工特征”,训练数据少,并不易适用于新数据。本研究的重点在于如何应用深度学习模型自动分级乳腺癌肿瘤等级以及自动分割口腔鳞状细胞癌上皮组织区域,并在多中心上评估模型的泛化性和评估模型自动分割区域和手工标注区域中提取特征的等效性。在乳腺癌自动分类系统研究中,对数量n=98个病人的98张全幅玻璃切片图像进行肿瘤级别的分类(其中肿瘤级别低的数量n=34例,肿瘤级别高的数量n=64例)。本研究使用了 ResNet分类神经网络,将交叉熵函数作为损失函数,并进行了重复5次的3折交叉验证。训练好的模型在外部测试集上的平均AUC(ROC曲线下与坐标轴围成的面积,Area Under ROC Curve)值为75.91%±7.60%。在上皮组织区域自动分割的研究中,使用了数量共n=640张的口腔癌症组织病理图像,构建了基于U-Net分割网络的自动上皮组织区域分割系统,并评估了从手动标记的上皮区域与自动分割区域中提取特征的等效性。训练后的模型在验证集的测试表明,模型在10倍放大倍数(即1.00微米/像素)下能够提供最佳的分割效果。定量分析实验中,模型生成的结果与病理学家的标记相比,其像素精度(分割结果像素级别精度)为88.05%,真阳率为82.74%,准确率为86.41%,Dice系数为84.53%。10倍放大倍数下训练的模型锁定为最终模型,将其用于独立测试集中测试和验证形态组学特征的等效性,实验证明了从手动标记的上皮组织区域和自动分割的上皮组织区域中提取的一系列常规手工组织形态特征是等效的,即大部分特征差异在统计学意义上不显著(p>0.05)。本研究通过乳腺癌自动分类及口腔癌上皮组织自动分割技术研究的结果表明,深度学习算法可以为病理学家提供自动、客观的分类及分割定量结果,提高诊断效率及准确率,展现了深度学习在肿瘤诊断中运用的可能性,为将来构建计算机辅助诊疗系统奠定基础。
其他文献
目的:生殖细胞肿瘤可以伴随精子发生障碍,是男性不育的重要原因。生殖干细胞的功能异常可导致生殖细胞肿瘤的发生。生殖干细胞的自我更新和分化潜能不仅受其内源性信号的影响,而且经历干细胞微环境的有序调控。模式动物果蝇的睾丸是研究生殖干细胞微环境调控非常理想的模型。核糖体小亚基蛋白RpS13被鉴定为调控果蝇睾丸生殖干细胞自我更新和分化的重要因子,然而,其在生殖干细胞微环境中的具体调控机制尚不明确。本研究旨在
学位
α,β-烯酮结构单元不仅在天然产物、药物、精细化学品等中广泛存在,而且常作为合成中间体被广泛应用于各种有机转化,因此其合成研究一直备受关注。α,β-炔酮的1,4-选择性还原是制备相应烯酮的重要策略,但因存在易过度还原、依赖贵金属、难以回收利用等问题,仍然是极具挑战性的课题。鉴于廉价金属钛(Ⅲ)配合物通过单电子还原机制衍生的催化应用已在环氧化合物、醛、酮、卤代烃等有机官能团的活化方面初露锋芒,结合我
学位
目的嗜麦芽窄食单胞菌是一种多重耐药的条件致病菌,通过分析其噬菌体的生物学特性与基因组学特点,为进一步深入研究噬菌体基因组学以及噬菌体替代疗法的应用研究提供数据与理论支持;对其裂解酶M15的表达和活性预测也为噬菌体制剂的下一步研究提供了实验依据和理论基础。方法观察该噬菌体在透射电镜下的形态后,通过测定其MOI、一步生长曲线、裂解谱及热稳定性、酸碱耐受性等分析其生物学特性;将该噬菌体基因组DNA进行全
学位
随着经济的快速发展和城市化进程的加快,水环境污染越来越严重,尤其是水体富营养化污染,它是当前人类共同面临的最棘手的环境问题之一。为了保护水环境,防控水体富营养化,我国乃至世界各国严格控制污染物的排放,提高了污水的排放标准,尤其是氮、磷排放标准。在污水排放标准提高的严峻形势下,我国污水处理厂面临着严重的挑战,尤其是老厂,提标改造势在必行。本文对铜山区新城污水处理厂的提标改造工程进行了系统研究。首先通
学位
张量积?的存在使得完备格范畴Sup成为了一个对称的Monoidal闭范畴,目前至少有三种不同的方式来刻画完备格的张量积.利用张量积可以研究特殊完备格的张量积,也可以将其应用于Quantale理论.本文主要从代数的角度来考虑张量积?的消去律问题,即什么条件下有下式成立:L?M≌N?M?OL≌N.(*)在Sup的满子范畴SSup中,张量积的消去律(*)与偏序集范畴Pos中笛卡尔积的消去律(**)是等价
学位
白细胞是维持人体免疫功能的关键元素,临床诊断中将观察不同种类白细胞的数量及形态作为诊断造血系统疾病的重要手段,因此,白细胞的检测在临床医疗领域至关重要,而白细胞图像检测又包括了图像采集、细胞分割、特征提取和分类识别几个步骤,白细胞分割是医学图像处理领域的一项富有挑战性的任务,其面临以下两个问题,一是白细胞种类多,且其形态复杂、变化多样,传统算法分割效果不佳,二是监督学习的分割算法往往需要大量专业人
学位
我国是农业强国,农业是我国的经济基础.害虫控制是影响农业发展的一个关键因素,其中化学防治是重要的手段之一.但是,随着化学农药的长期和高频率使用,害虫的抗药性愈发凸显,引起了国内外许多专家学者的广泛关注.为了有效地控制抗药性的发展,达到害虫控制的目的,各国专家学者们提出了许多控制策略.其中,最常用的策略就是,在对害虫采取化学控制的同时,采取其他控制手段,例如生物控制,即投放天敌.同时,害虫控制的目标
学位
工业建筑遗产是工业革命的产物,也是人类历史文明的产物。在社会的发展过程中,工业建筑遗产做出了巨大贡献,对建筑、生态、文化、社会经济等都有不可磨灭的价值。工业建筑遗产是城市工业文明的象征和历史文脉的载体。目前,国内工业建筑遗产随着产业转型,其数量不断增多,出现了一大批的工业厂房、车间、工业生产建筑、机械设备及相关文件资料等。这些物质遗产与非物质遗产因缺乏法律保护而遭到破坏,使得工业文化的传承出现了断
学位
声音事件检测的主要目的是检测出音频中声音事件对应的类别和起止时间。在某些特殊环境中,如黑暗、光照影响、视野盲区等,声音事件检测可以弥补仅依靠视觉检测方法的不足,大大提高检测可靠性,发挥其独特的优势。作为计算机听觉领域的热点问题,声音事件检测已经在智能家居、安全监控、智慧医疗、生物多样性监测等多个领域得到广泛应用,为人们带来了更便捷、更安全、更舒适的生活方式。声音事件检测的应用前景较为广阔,具有重要
学位
癌症与传染病是现代医学中急待攻克的两大难题.数学方法为解决这些医学难题提供了理论支撑,特别是通过建立微分方程模型的方法,人们能够更加直观地刻画出某些复杂的病理过程,从而对疾病的治愈提供了理论上的帮助.本文分析了一类癌细胞侵袭模型及一类抗逆转录病毒疗法治疗HIV模型.癌细胞的侵袭扩散行为对癌症的治愈提出了巨大的挑战,这吸引了一大批学者通过建立相应的数学模型来研究癌细胞在人体侵袭扩散的生物机制.本文第
学位