【摘 要】
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由于必需基因在生物生存生长中的重要作用,这类基因一直被视为生命存活的关键。通过对十个原核生物基因组的分析,我们发现虽然每个基因组内前导链上基因数均大于滞后链,然而
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由于必需基因在生物生存生长中的重要作用,这类基因一直被视为生命存活的关键。通过对十个原核生物基因组的分析,我们发现虽然每个基因组内前导链上基因数均大于滞后链,然而如果将必需基因与非必需基因相比,其中三种微生物的必需基因没有表现出比非必需基因更加偏好前导链。继而,我们以大肠杆菌为例,按4个大类及25个子类的COG功能类别将大肠杆菌基因分组对比,发现只有J(翻译、核糖体结构与合成)和M(细胞壁、细胞膜、包膜的合成)两个COG功能子类、Ⅰ和Ⅱ两个COG功能大类下的必需基因与非必需基因相比表现出了对前导链明显的偏好,这一发现部分吻合前人的结论,同时说明必需基因对于前导链的偏好存在功能特异性和物种特异性。接着,我们对大肠杆菌必需基因的长度特征进行了统计。分析发现,无论是必需基因还是非必需基因,各自在前导链与滞后链之间没有表现出长度差异;然而无论是在前导链上还是滞后链上,必需基因与非必需基因之间的长度都表现出了明显差异。将这一发现扩展到全部十个原核生物基因组中进行验证,发现在全基因组水平上,除了大肠杆菌之外,H. pylori等四种原核生物也都不同形式的表现出了必需基因与非必需基因间的长度差异。在对这一现象进一步细化分析后发现,这种长度上的显著性差异虽然普遍存在,然而各物种、各功能类基因之间有不同体现,只有在J、K、L三个功能子类中的基因表现出比较一致的长度差异,而且在J、K、L、0四类基因中观察到了必需基因比非必需基因离散程度更高。我们推测,这种物种间的、功能性的差别,很可能是原核生物基因在进化过程中受不同种类自然选择作用的结果,基因长度、离散度的变化可能增加了基因组的多样性和物种的适应性。
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