LPNA3在乳腺癌中表达水平及临床意义的研究

来源 :皖南医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:JK0803zhushuangyi
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目的:本研究拟通过生物信息学技术结合反转录聚合酶链式反应(RTPCR)及免疫组化(IHC)检测LPNA3在乳腺癌(BC)中的表达情况,探究LPNA3的表达水平与BC患者的临床病理情况及预后是否存在相关性,进一步研论LPNA3在临床治疗靶点和预后标志物方面的临床应用价值。方法:使用R软件从美国癌症基因组图谱(TCGA)数据集中提取BC的LPNA3表达数据和临床信息,从临床分期、分子亚型、ER和PR状态等不同角度探讨LPNA3在BC中的表达水平。然后,对LPNA3共表达基因进行功能富集分析(GO)、信号通路富集分析(KEGG)和基因集富集分析(GSEA),以评估LPNA3在BC中发挥的作用。为明确临床价值,我们通过Kaplan-Meier ploter进行生存分析,评估LPNA3在BC中的预后价值。最后收集我院临床病理资料完整的BC癌组织与癌旁组织标本,通过RT-PCR和IHC检测LPNA3的核酸水平及蛋白表达水平。用SPSS分析LPNA3的表达水平与BC患者临床资料及预后的关系,Graph Pad Prism9行可视化处理。结果:生物信息学分析发现:与癌旁组织相比,LPNA3在BC组织中的表达水平较高。其中,LPNA3在晚期BC,ER阴性组,PR阴性组和Basal亚型中具有较高的表达水平;然后,GO、KEGG和GSEA结果表明,LPNA3主要参与基因转化调控过程和具备粘附功能;最后,生存分析结果表明,与LPNA3表达水平较高的患者相比,LPNA3表达水平较低的患者预后良好。RT-PCR及IHC的结果表明,相较于BC癌旁组织,LPNA3在癌组织中呈高表达水平。结论:本研究通过生物信息学分析结合RT-PCR及IHC初步验证,结果发现LPNA3在BC中高表达,可能是潜在的致癌基因,而且可能通过强化癌细胞的转化调控和粘附能力而发挥促癌的作用;生存分析结果提示LPNA3高表达的BC患者预后欠佳。因此值得深入研究LPNA3潜在的致癌机制,进一步为临床诊疗提供新的治疗靶点和作为预后不良的生物标志物。
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