近几年来,我国经济的繁荣,就业问题的缓解以及在创新、扩大出口等方面的进步都离不开我国中小企业的大力支持,而且中小企业正以较快的发展速度不断扩大数量。然而中小企业在投资过程中的非效率投资问题却成了中小企业发展的绊脚石。引起中小企的非效率投资因素主要有两方面;一是外部融资问题,二是企业内部代理问题导致的利益冲突问题。因此,中小企业投资效率问题应得到重视并解决,这样企业的价值才会提升,我国的金融体系才会完善。本文首先对中小企业在经济发展中的作用和发展现状进行分析,进而分析了与非效率投资的相关的信息不对称理论、委托代理理论、和自由现金流理论,并结合我国中小企业板上市公司的特点分析以上三个理论如何引起非效率投资问题,在理论基础之上系统的分析我国中小企业板上市公司的融资情况和投资情况,并总结出影响中小企业非效率投资的因素。最后进行实证分析,首先分析总体负债、债务期限结构以及债务来源结构对企业非效率投资的影响,其次从股权集中度、股权制衡、管理层持股三方面来研究股权结构对非效率投资的影响。本文选取2012-2014年中小企业板上市公司作为研究对象,运用spss22.0软件进行模型的实证分析。我国中小企业板上市公司的融资情况和投资情况以及模型的实证分析结果得出我国中小企业普遍存在融资约束和投资不足的非效率投资行为,进而分析了影响企业非效率投资的因素。从融资情况来看,中小企业主要以外部融资为主,并且债务融资略高于股权融资,本文首先从总体债务,债务期限及债务来源(银行借款、商业信用)三方面分析了债务融资对非效率投资的影响,实证结果表明债务不但没有引起投资不足,而且还缓解了投资不足,与银行借款相比,商业信用更能有效的抑制投资不足,短期借款比长期借款更能有效的缓解投资不足。从股权结构角度得出第一大股东持股比例普遍较高从而导致投资不足,管理层持股可以有效的缓解投资不足,在中小企业中股权制衡作用不明显,不能有效地抑制企业的非效率投资。本文根据以上结论提出相应的政策建议,解决中小企业融资难的问题;完善商业信用负债市场;银行扩大对中小企业长期贷款比例;合理分配股权,发挥股权制衡作用。