纹带棒状杆菌分子分型及临床感染危险因素分析

来源 :华北理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liubingonline
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目的通过对华北理工大学附属医院2017年10月~2021年5月临床感染纹带棒状杆菌菌株的耐药性、同源性及基因组特征研究,揭示我院多重耐药纹带棒状杆菌院内长期存在并持续传播的现象。追踪感染纹带棒状杆菌患者的临床特征,进一步探讨其感染的危险因素,及早为患者建立明确而快速的诊断和治疗,制定院内预防控制感染策略。方法收集并鉴定临床分离非重复纹带棒状杆菌89株。经VITEK2-Compact全自动细菌仪联合16S r RNA鉴定为纹带棒状杆菌。对所有菌株进行药敏试验、脉冲场凝胶电泳、全基因组测序。使用Bio Numerics软件分子分型分析,使用CARD数据库进行耐药基因检索,使用RAx ML 8.2.4软件根据89株菌的核心SNP用最大似然法构建系统进化树。筛选出76例确诊感染且病例资料完整的患者作为致病组,进一步讨论感染纹带棒状杆菌的临床危险因素,以同期纹带棒状杆菌定植组的患者作为对照,分别追踪致病组和定植组患者的临床资料,运用SPSS21.0软件对纹带棒状杆菌感染患者的生存率、临床感染的危险因素分析比较。结果1在2017年至2021年检出的89株纹带棒状杆菌中,主要分离自重症监护病房(48,53.93%)和神经外科病房(28,31.46%),标本来源主要为呼吸道深部痰标本(81,91.01%)。2药敏试验结果显示,在本研究中,89株纹带棒状杆菌未检出对利奈唑胺及万古霉素耐药菌株,所有菌株对环丙沙星(89,100.0%)全部耐药,其次为头孢噻肟(87,97.7%)、美罗培南、克林霉素、红霉素和青霉素的耐药率相同(85,95.5%)、庆大霉素(74,83.1%),对利福平、四环素、多西环素的耐药率在50%以下。3从CARD数据库检索出identity在90%以上的基因有16种,对不同时间段检出纹带棒状杆菌携带的耐药基因进行统计学分析,tet(W/N/W)、tet44、AAC(6’)-Ia、AAC(6’)-Ib10、aad A、APH(3’’)-Ib、APH(3’)-Ia等基因P<0.05,有统计学差异。4耐药基因和耐药表型匹配情况显示,大环内酯类耐药基因和耐药表型匹配度最高(92.1%),其次是氨基糖苷类(78.7%),四环素类耐药基因与耐药表型的匹配度只有46%。5脉冲场凝胶电泳结果分析,89株纹带棒状杆菌共分为39个PFGE带型,有5个优势型别,有28株菌有其独特型别。6全基因组测序结果,89株纹带棒状杆菌核心基因组中共有93,492个SNP。从系统进化树中可以看出,89株纹带棒状杆菌在我院传播流行时可以分为四个主要的分支,Clade B和Clade D是在这期间院内传播的两个主要优势克隆群。7纹带棒状杆菌致病组的死亡率高于定植组(P<0.05)。感染前使用激素(OR=0.202,P=0.001)、腰穿(OR=0.055,P=0.008)、气管切开(OR=21.228,P=0.000)、留置侵入性器械(OR=4.725,P=0.022)是纹带棒状杆菌临床感染的独立危险因素。8感染前使用激素(OR=0.197,P=0.002)、低蛋白血症(OR=0.287,P=0.032)、感染前入住ICU(OR=13.594,P=0.000)是纹带棒状杆菌呼吸道感染的独立危险因素。结论1临床感染纹带棒状杆菌患者主要来自重症监护病房和神经外科病房,分离时间有集中的现象。标本来源主要来自深部痰标本。2临床检出纹带棒状杆菌多为多重耐药纹带棒状杆菌,给临床治疗带来了困难。3纹带棒状杆菌耐药机制尚不明确,且耐药基因与耐药表型的匹配程度不高,纹带棒状杆菌在进化的过程中能逐渐获得并累积对抗生素的抗性及相应耐药基因。4本研究采用PFGE联合基因组测序分析,阐明了院内流行纹带棒状杆菌系统进化关系,揭示了多重耐药纹带棒状杆菌院内流行特征。5纹带棒状杆菌致病组患者的入院60天生存率明显低于定植组,气管切开、腰穿、留置侵入性器械、感染前使用激素是纹带棒状杆菌的临床感染危险因素。6呼吸道感染纹带棒状杆菌致病组患者的入院60天生存率低于定植组,感染前使用激素、低蛋白血症、感染前入住ICU是呼吸道感染纹带棒状杆菌的临床感染危险因素。7对临床感染纹带棒状杆菌的防控要从多个方面共同努力,要求临床工作人员合理使用激素,尽量减少侵入性操作,减少导管留置时间,严格执行无菌操作。降低感染的发生率,以增加患者生存率。通过加强终末消毒和护理措施,提高患者基础疾病的预后条件。图 16 幅;表 17 个;参 95 篇。
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