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花鼠(Tamias sibiricus)是一种啮齿目的小型哺乳动物,有冬眠的习性。其生存环境四季分明,食物资源不尽相同。有研究表明,食物的改变会影响其肠道菌群的变化,所以我们推测花鼠的肠道菌群会根据季节的变化而改变。目前未见有关花鼠肠道菌群的相关研究报道,我们期望通过本研究,了解花鼠肠道菌群的基本结构以及随季节的变化,丰富对花鼠营养生态学的认识。我们于2017年春季、夏季、秋季分别在黑龙江凉水国家级自然保护区采用笼捕法活捕花鼠个体,每个季节捕捉10只,共捕捉30只。在保护区的实验室中收集被捕捉花鼠的粪便样品,收集完成后将花鼠在捕捉地放归。对收集到的粪便样品分别进行16S rRNA高通量测序。根据测序结果,我们首先描述了花鼠肠道菌群的结构,进而分析花鼠肠道菌群随季节的变化,最后得出花鼠肠道菌群的季节变化与食物变化有关的结论。主要研究结果如下:1.所有样品中一共得到3062个OTU,春夏秋三组样品分别得到2894、3425、3384个OTU。在所有样品中一共注释到确定的11个门,21个纲,35个目,75个科,134个属。2.从花鼠肠道菌群结构上来看,厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)是花鼠肠道菌群的主要优势菌门;优势菌科为乳杆菌科(Lactobacillaceae)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、S24-7菌科;在属水平上,优势菌属是乳酸属(Lactobacillus)。3.不同季节花鼠的肠道菌群结构具有显著差异。在门分类水平,变形菌门在春季到秋季显著增长(df=18,t=-3.369,F=4.127,P=0.003)。在科分类水平,乳杆菌科(Lactobacillaceae)和 S24-7 菌科是春季组的优势菌科,肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、S24-7 菌科、乳杆菌科、疣微菌科(Ruminococcaceae)是夏秋季两组的优势菌科。其中,乳杆菌科从春季到夏秋两季显著减少(df=18,t=3.244,F=1.882,P=0.005;df=18,t=2.766,F=1.688,P=0.013)。肠杆菌科从春季到秋季显著增加(df=18,t=-3.400,F=3.739,P=0.003)。在属分类水平,除去所有未被确定的菌属外,优势菌属是乳酸属(Lactobacillus),春季到夏秋两季显著减少(df=18,t=3.244,F=1.882,P=0.005;df=18,t=2.766,F=1.688,P=0.013)。4.α多样性分析得出,夏季花鼠肠道菌群的多样性最高。通过PCA分析得出,秋季组组内相似性最高;通过NMDS分析得出,春夏两组肠道菌群结构更加相似。