在“双碳”目标背景下，如何权衡增长效率和低碳减排是一项重要议题。基于新结构经济学视角，构建低碳经济转型分析框架，采用绿色技术选择指数测度绿色发展战略，选取2000—2020年中国省级面板数据，使用动态空间杜宾模型和系统广义矩估计法分析绿色发展战略对低碳经济转型的影响。研究结果显示：第一，绿色发展战略具有“经济效应”和“减排效应”双重作用，绿色发展战略与低碳经济发展水平和碳排放总量之间分别呈现倒U型和U型关系，临界值为1.228和1.196。第二，低碳经济转型表现出时间惯性效应和空间溢出效应，对本地及周边地区产生较为显著的正向影响。第三，绿色发展战略在东部、中部和西部地区的影响具有异质性，西部地区产业耦合程度较弱，减排效应尚不明显。第四，遵循比较优势的绿色发展战略在微观层面能够增强企业自生能力，促进绿色创新研发活动；在宏观层面能够提高绿色部门的规模比重，推动低碳经济转型。上述结论在进行一系列稳健性检验之后仍然成立，为中国经济高质量发展提供了理论依据和经验证据。