高等教育是培养人才、推动科技进步和创新的重要途径，而数字经济则是当前全球经济发展的重要趋势，高等教育与数字经济的互动与共生已经成为不可忽视的趋势。在对高等教育与数字经济耦合机理进行探讨的基础上，以中国大陆31个省市2013—2020年的面板数据为例，利用变异系数法、耦合协调度模型、Dagum基尼系数对中国省域高等教育与数字经济耦合协调发展水平及其地区差异进行分析。研究结果表明：（1）研究期内各省市高等教育与数字经济均有不同程度的发展，总体上江苏、广东、山东、河南、湖北的高等教育发展水平以及上海、北京、浙江、广东、江苏的数字经济发展水平处于全国前列，高等教育弱—数字经济弱、高等教育强—数字经济弱是主要的省市分布类型。（2）从全国尺度来看，中国高等教育与数字经济耦合协调度呈现出稳步上升的态势，但水平仍相对较低。省域尺度来看，河北、广东、贵州的高等教育与数字经济耦合协调发展水平上升较快，而辽宁与福建的高等教育与数字经济耦合协调发展水平上升较慢，省域高等教育与数字经济耦合协调度整体呈现出较明显的梯队分布特征，高等教育与数字经济耦合协调等级已经由严重失调、中度失调为主过渡到轻度失调、濒临失调为主。（3）中国省域高等教育与数字经济耦合协调度发展差异在逐步减小，差异的主要来源是地区间的不平衡。进一步研究发现，东部地区内部以及东部地区与西部地区之间的高等教育与数字经济耦合协调度差异最为突出。最后，从以数字经济发展水平提升为重要抓手，补齐数字经济短板，发挥北京、江苏、上海、广东、浙江等高等教育与数字经济耦合协调发展第一梯队的领头羊作用，缩小东部地区内部省市以及东西部地区之间高等教育与数字经济耦合协调度差异等方面提出相关对策建议。