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研究2010年南京市手足口病的病原构成及肠道病毒71型(EV71)VP1编码区基因特征。
方法采集南京儿童医院手足口病住院患儿的248份咽拭子标本，进行病毒分离，然后利用real－time PCR法对阳性分离物进行肠道病毒属、EV71和柯萨奇病毒A16型(Cox A16)鉴定。选取临床诊断为普通型病例、重型病例和危重型病例的EV71共20株进行VP1编码基因区基因扩增及核苷酸序列测定和分析，然后与EV71各基因型和基因亚型的代表株构建亲缘性进化树。
结果248份咽拭子标本共分离出146株病毒分离物。其中110株EV71，阳性率为44.35%，28株Cox A16，阳性率为11.29%，其他肠道病毒8株，占3.23%。对20株EV71进行VP1区核苷酸和氨基酸分析，发现其同源性较高，分别为95.51%～100%和98.32%～100%。构建亲缘性进化树显示20株EV71与C4基因亚型的代表株处于同一分支，属于C4基因亚型。
结论南京地区2010年手足口病病原以EV71为主，且流行基因型为C4基因亚型；不同病例分型的EV71在VP1区未发现明显差异。