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目的
了解深圳市H5N6、H7N9流感病毒HA基因非翻译区(Untranslated region, UTR)的分子特征。
方法使用MEGA7.0、DNAStar7.1.0等生物信息学分析软件对全球及深圳H5N6、H7N9流感病毒HA基因的UTR进行核苷酸序列同源性分析及基因多态性分析。
结果3株2014—2015年深圳市H5N6病毒与其他H5NX病毒株比较,HA-3’UTR核苷酸同源性为77.4%~100%,H5N6-HA-3’UTR未见明显突变位点;HA-5’UTR核苷酸同源性为91.7%~100%,H5N6-HA-5’UTR第24、31位发生突变。11株2013—2014年深圳市H7N9病毒与其他H7NX病毒株比较,HA-5’UTR核苷酸同源性为81.2%~100%,H7N9-HA-5’UTR在第2~6、9、10、12及15~17位发生多位点突变。
结论深圳市人感染H5N6及H7N9病毒HA的UTR保守区高度同源性及其可变区具有基因多态性。