【摘 要】
:
目的:筛选和分析大鼠胶质瘤模型与正常星型胶质细胞中的差异表达基因。方法:构建大鼠C6颅内胶质瘤模型,利用Illumina Hi Seq 4000技术对大鼠胶质瘤模型的胶质细胞和正常星形
【机 构】
:
徐州医科大学医学信息学院; 徐州医科大学神经生物学实验中心;
【基金项目】
:
国家自然科学基金(81372698);江苏省博士后科研资助计划(1601080C);江苏省高校自然科学研究面上项目(17KJB310015);江苏省高等学校大学生实践创新训练计划项目(201810313071H);徐州医科大学优秀人才科研启动基金(D2015001)
论文部分内容阅读
目的:筛选和分析大鼠胶质瘤模型与正常星型胶质细胞中的差异表达基因。方法:构建大鼠C6颅内胶质瘤模型,利用Illumina Hi Seq 4000技术对大鼠胶质瘤模型的胶质细胞和正常星形胶质细胞进行转录组测序并对测序结果进行功能注释。以q值<0. 05为标准筛选差异表达基因,并通过GO和KEGG数据库分析其功能和参与的信号通路。结果:较之正常星形胶质细胞,大鼠胶质瘤模型组细胞共筛选得到9221个差异表达基因,其中4604个基因表达上调,4617个基因表达下调; GO富集结果表明:这些差异表达基因共映射到575个GO term,与各类结合相关的分子如蛋白结合、离子结合、小分子结合、核苷酸结合等功能富集显著; KEGG富集结果表明:差异表达基因共参与22条通路,富集最多的是癌症发生通路、MAPK通路、胞吞通路和黏着斑通路。结论:成功获取大鼠胶质瘤模型细胞与正常胶质细胞的基因表达谱,差异表达基因富集在癌症发生通路、MAPK通路、胞吞作用通路和黏着斑等生物学通路,这些信号通路可能在胶质瘤发生发展过程中发挥重要作用,对其进一步分析将为临床治疗胶质瘤提供新的靶点。
其他文献
传统文化与现代文化并存,基于传统文化教育对青少年继承和发扬民族文化遗产,增强民族自信心,树立广阔的文化视野及人文素质有着重要意义。本文以少儿电视文化活动的策划与编
熵(Entropy)是一种非线性动力学参数,其概念是由德国物理学家克劳修斯于1865年所提出,应用于热力学中,并于1948年由香农(Shannon)将其引入信息论中,在控制论、概率论、数论、天体
人文素养,是以人为中心的人文知识、人文环境和人文精神在人性修养中的崇高和永恒的价值取向,是以完善人格为最终目标的科学精神。注重中小学生人文素养教育,这即是学校开展思想
对不同做青方式下,凤凰单枞乌龙茶内源生化指标及其品质的变化规律进行研究。结果表明,桂花香型凤凰单枞乌龙茶对机械摇青比较敏感,表现为PPO活性高峰由19.36U/g提高到23.33U
处理好经济发展和社会和谐的关系至关重要,系统地探索我国社会经济转型时期和谐社会建设的影响机制,不仅利于社会稳定发展,而且有助于管理科学理论自身的知识创新。和谐社会
先前在一年级学生刚入学的时候,语文老师常常采用“口读手划”方法来进行生字笔顺的“书空”练习。这种方法,学生的脑、口、手、眼的参与度相对较高。但是,随着年级的升高,这种方
针对中国铁路昆明局集团有限公司某车辆检修钩缓车间室内废气粉尘治理的需求,结合国内外最新的研究成果及实用技术,从车间污染的形成、特点及工艺入手,通过引进、吸收、集成
2014年下半年我国机械制造企业接连发生几起特别重大的安全责任事故,如:2014年8月2日江苏省昆山市中荣金属制品有限公司发生特别重大铝粉尘爆炸事故;2014年12月31日广东富华工
喷射铸造-X工艺是Osprey金属公司喷射成形工艺的改进,采用这种工艺能经济地生产出高质量的用于燃气涡轮发动机镍基高温合金,而且将其一步直接转换成环状半成品。一种第三代生
<正> 财务软件开发既要照顾到会计数据以磁性信息形式传递的方便性,又要顾及到会计人员之间分工协作的可行性。较之一般的数据处理软件,财务软件数据加密还存在着使用的方便