按所修学分进行收费是学分制教学改革的一个显著表现形式。那么，学分制教学较之原本的教学机制，将带来怎样的变化？正在参与学分制收费改革设计的山东省教育厅高教处相关负责人李霞的观点很有代表性：“学分制收费的核心是选课制，由此将带来高等学校教育教学和人才培养模式的一系列改革。”
　　推动高校管理精细化
　　中国的一些大学实施学分制后，学生的确获得了更大的学习自主权。学校与学生之间从简单的管理与学习关系，演变为具有更多类似合同约定的契约关系。选课使得学生的学习和学校教学安排产生了直接联系，一旦哪门课程安排不力，就产生了违约事实。学生身份向消费者的转变，产生了消费者选择权并受到了契约保护。高校为保证教学履约，就必须加快教学资源建设，开设数量充足的课程供学生修读。理论上，选课后的每个学生都将有自己独特的一张课程表。80%以上的必修课将实现同一门课程两名以上教师授课，学生可以相对自主选择上课时段和授课教师。通过学生选课，将推动淘汰教学责任心不强、教学效果不好的教师，有利于教师自觉提高教学水平。
　　“与此相适应，高校必须深化内部管理体制改革，修订专业人才培养方案，制定与学分制管理相适应的教学管理、收费管理、教师管理、学生管理、学籍管理、选课管理、实验室管理、成绩管理、教学质量管理等规章制度，这将是对高校现有管理体制的重大挑战，也是高校破除原有体制诟病，焕发生机活力的重要机遇。”李霞表示。
　　要真正实施“按学分收费”，尚有很多问题需要解决，比如：学生的自主选择与学校的教学设计有冲突怎么办？师资短缺，学生可选的课程不多怎么办？解决这些问题，离不开学生的参与。
　　让学生发展更自由
　　按学分制收费后，大学生提前毕业或在校创业更加成为可能。不少高校学分制改革后，实行弹性修业年限，以4年制本科为例，可以提前1年毕业或延长到8年毕业，因此3年至8年都是合法的修业时间。如果学生需要在校期间创业，允许离校2次共计2年，学校将会保留其学籍。学生还可以在更大范围内修读双学位和辅修第二专业，所有专业都具有选修双学位、辅修第二专业的资格。
　　改革后，学生课程考核不合格，或考核合格但对成绩不满意，可以申请重修，多次重修的课程按最好成绩记载入学生档案。不再有留级和降级，部分课程还可申请免修和免听。
　　2011年9月，武汉大学正式实行学分制改革方案。学校规定，课程不及格，可免费补考一次。补考再不及格，或需要再次重新学习该门课程的学生，学校可按学分再次收取学费，学分学费标准不得超过原来学习该门课程的费用标准。
　　“此项改革，将赋予学生在选课方面更多的自主权。”武汉大学教务部副部长黄本笑说，同时该项措施还可鼓励各学院开设更多面向全校学生的通识课程。若有学生3年就可以将课程修完，再收4年的学费就不公平。按学分收费也鼓励一些学有余力的学生，跨学科学习更多的课程。同时，他认为学分制收费也将给教师带来良性竞争，会提高整体教学质量。
　　“我现在的课表，怎一个乱字了得！”武汉大学2010级学生张好雨无奈地说，由于选课竞争，喜欢的专业课被其他学生选完了，他只能选其它课，结果自己课表的时间很冲突，都没有时间选体育课。张好雨的无奈反映了他对自己学业的责任感。学分制收费撬动了学生的责任感，“逼迫”学生认真学习，“毕竟每节课都要收钱”，同时也对教师形成了激励和淘汰机制。对比原有的学年学费制度，学生只要按部就班就能完成学业，而学分制则引入了经济杠杆，迫使学生更好地自我管理。
　　也要防浑水摸鱼乱收费
　　按学分收费以后，一些高校会不会借改革之机巧立名目收费，变相提高收费标准？会不会比以前按学年收费价格更高呢？教师“会不会人为提高挂科率”？
　　在社会广泛关注、物价局监督和学校一再的保证下，高校利用学分制收费改革提价的空间并不大，但也还是有缝隙可钻。比如，校方故意混淆不同学科的学分内涵，给不同学科的学费定价有的一致，有的不一致，偏向于向高标准看齐，已成为学分制改革趁乱涨价的一个明显漏洞。
　　山东大学今年实行学分制收费后，就被认为是收费明显增加，有学生就发帖称，实际缴费普遍比报考指南的标准高出了两三千元。2013级土木工程学生赵晓说，在报考指南上，他所学专业的学费标准是4300元。而通知书上，大一的学费是6500元，上涨了2000多元。同样，艺术类学生的学费也上浮了不少。
　　山东大学的学分制收费，是将原来按学年收费，改为弹性的按学分收费的典型模式。学分制收费包括两部分，一部分为专业注册学费，按照学生实际在校就读的学年收费；另一部分就是学分学费，按照学生修读课程的学分收费。按照官方网站所刊登的《山东大学本科生预收学分学费标准表》，学生每选一个学分，就要花100元。改革的确给公众带来了不适应，新政还需要时间来消化。