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目的
探讨中药黄连抑制多耐药尿道致病性大肠埃希菌作用的分子机制。
方法应用RNA-seq技术分析黄连对尿道致病性大肠埃希菌(uropathogenic Escherichia coli，UPEC)临床分离株(NB8株)转录组的影响。琼脂稀释法测定黄连水煎液对UPEC临床分离株(NB8株)的最低抑菌浓度(MIC)，检测黄连水煎液对病原菌生长曲线的影响；用10倍MIC的黄连水煎液作用于UPEC NB8株菌30 min后，提取UPEC NB8株菌总RNA，去除rRNA，反转录合成cDNA，在HiSeq2000测序平台上进行转录组测序，通过分析软件(tophat＋cufflinks)构建转录本并计算表达量，并将得到的表达谱进行差异表达、GO功能富集以及KEGG代谢通路分析，另使用生理盐水处理UPEC NB8株菌为阴性对照。
结果黄连水煎液对UPEC NB8株的MIC为12.5 mg/ml。UPEC NB8株菌黄连处理组有3665个基因表达，生理盐水对照组有3430个基因表达，差异表达基因共有1428个，其中上调基因921个、下调基因507个，差异基因主要富集在结合与催化模块中，细胞黏附、凋亡及多细胞过程中的基因上调，参与酶活性调节的基因下调；KEGG代谢通路富集分析发现，脂多糖合成通路相关基因呈显著上调、与DNA复制相关的修复聚合酶Ⅲ呈现较显著的上调趋势，脂肪酸代谢、组氨酸代谢、硫胺代谢及叶酸代谢、核糖体合成的铁载体组呈现整体下调趋势。
结论获得了黄连水煎液作用于UPEC的表达谱，阐述了黄连抑制UPEC生长的分子机制，主要机制在于破坏UPEC的细胞壁、影响DNA的复制以及蛋白质的转录和翻译等，说明黄连水煎液对于UPEC的抑制是多方面多层次的。