【摘 要】
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目的分析遵义地区淋球菌por,tbp B基因序列变异及系统进化关系。方法对淋球菌por,tbp B基因进行测序鉴定,利用NG-MAST分型法对por,tbp B基因进行比对编号。用MEGA5.22软件中
【机 构】
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遵义医学院附属医院输血科,遵义医学院附属医院医学检验科,遵义医学院附属医院核医学科,
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目的分析遵义地区淋球菌por,tbp B基因序列变异及系统进化关系。方法对淋球菌por,tbp B基因进行测序鉴定,利用NG-MAST分型法对por,tbp B基因进行比对编号。用MEGA5.22软件中的邻接法构建系统发育树,并以Kimura 2-parameter模型计算序列间的遗传距离;Felsenstein法计算同义替换率(dS)和非同义替换率(dN)。以RDP3软件对por,tbp B基因中的基因重组事件进行分析。结果 65株淋球菌共鉴定出19种por基因型和22种tbp B基因型。19种por基因型被划分为2个进化簇群,基因间平均遗传距离0.09。22种tbp B基因型被划分为3个进化簇群,基因间平均遗传距离0.13。por,tbp B基因的dN<dS。在tbp B基因中检测出8个基因重组事件,而por基因仅有1个。结论本地区淋球菌por基因与tbp B基因的进化速度与方式存在一定差异,其中tbp B基因主要以基因重组的方式参与进化,por基因则可能以突变或缺失的方式参与进化。纯选择作用是维持本地区por,tbp B基因多态性的重要机制。
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