磁珠快速提取乙型肝炎病毒DNA方法的建立及其应用研究

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目的

建立一种基于磁珠法的快捷、简便、高纯度血液HBV DNA提取方法(以下简称磁珠法),为用于临床自动化定量检测的核酸诊断试剂研发提供技术支持。

方法

用科华生物公司内部5份HBV强阳性血清标本,先通过磁珠的磁性、悬浮性、HBV DNA提取效果等对4种磁珠(A~D磁珠)进行筛选,并对磁珠用量(1~1.75 μl/ml)、裂解液pH值(4~9)、洗涤液中是否加入乙醇和洗脱液带磁珠扩增等条件进行系统优化;并对建立的磁珠法线性范围、精密度、灵敏度、抗污染和抗干扰能力等技术性能进行评价。然后,分别用磁珠法与国内成熟的煮沸法定量检测100份HBV血清标本,用磁珠法与国际“金标准”Roche COBAS TaqMan Test(以下简称Roche法)定量检测50份HBV血清标本,并比较分析3种方法的相关性。

结果

通过实验条件优选试验确定超顺磁A磁珠在物理性能和DNA提取效果都优于其他3种磁珠,磁珠最佳使用量为1.25 μl/ml,裂解液最佳pH值为7~8,洗涤液中可去除乙醇成分,并可直接带磁珠进行扩增反应。通过平行检测5份公司内部HBV强阳性血清标本以及梯度稀释的血清标本确定磁珠法的线性范围为4×101~4×108 IU/ml,煮沸法为4×102~4×108 IU/ml;磁珠法检测灵敏度为30 IU/ml,高于煮沸法(100 IU/ml);在低浓度HBV血清标本检测中,磁珠法的精密度(CV为6.0%)优于煮沸法(CV为11.9%);磁珠法检测的假阳性率为0,而煮沸法假阳性率为3.1%,磁珠法抗污染能力优于煮沸法;煮沸法在标本中肝素钠含量达到62.5 U/ml时,检出血清中HBV DNA含量明显下降,当肝素钠达1000 U/ml时,无法检出HBV DNA,而肝素钠对磁珠法几乎无影响。同时,磁珠法和煮沸法平行检测100份临床HBV血清标本,磁珠法的阳性率(86%)高于煮沸法(74%),且2种方法的相关性较好(R2=0.948,P<0.05);磁珠法和Roche法平行检测50份临床HBV血清标本,磁珠法检出阳性率[95%(49/50)]与Roche法[100%(50/50)]接近,2种方法间有显著相关性(R2=0.963,P<0.05)。

结论

建立的磁珠法定量检测HBV DNA的得率高,具有较宽的检测范围、定量准确、操作简单,可作为实验室首选的核酸提取方法用于临床乙型肝炎诊断。(中华检验医学杂志,2012,35:843-850)

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