【摘 要】
：
目的 预测微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum)假定棒状体蛋白1(putative rhoptry protein-1,CpPRP1)中Sushi结构域(CpSushi)蛋白片段的结构、理化性质、翻译后修饰位点及
【机 构】
：
中国农业科学院上海兽医研究所,农业农村部动物产品质量安全生物性危害因子风险评估实验室(上海),农业农村部动物寄生虫学重点实验室,上海200241
论文部分内容阅读
目的 预测微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum)假定棒状体蛋白1(putative rhoptry protein-1,CpPRP1)中Sushi结构域(CpSushi)蛋白片段的结构、理化性质、翻译后修饰位点及抗原表位等信息. 方法 利用在线软件Protparam分析CpSushi蛋白片段的等电点、消光系数、分子质量等理化性质;利用Protscale软件分析蛋白片段的亲/疏水性;利用SignalP软件预测其信号肽;利用TargetP软件预测其亚细胞结构;利用KinasePhos、NetPhos以及NetO-Glyc、NetNGlyc、NetCGlyc软件分别预测其翻译后激酶磷酸化、磷酸化及O/N/C-GlcNAc糖基化位点;利用SOPMA、COILS、Bcepred软件分别分析其二级结构、卷曲螺旋,以及柔韧性、表面可及性、转动、暴露表面及抗原倾向;TMHMM软件预测其跨膜结构域;ABCpred、Syfpeithi软件分别预测其B、T细胞抗原表位;STRING软件预测与其互作的蛋白.结果 CpSushi蛋白片段有237个氨基酸残基,分子质量为26 ku,有两个疏水峰;该蛋白无信号肽、跨膜结构域;α-螺旋、延伸链、β转角、无规则卷曲所占比例分别为28.27％、18.99％、8.86％和43.88％,且能形成规则的卷曲螺旋结构;含有22个O-GlcNAc和2个N-GlcNAc-糖基化修饰位点,但缺乏C-GlcNAc糖基化位点;其氨基酸序列中存在多处丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸磷酸化位点,蛋白的柔韧性(临界值1.9)、极性(临界值1.8)、亲水性(临界值1.9)位点分别有16、18和8个;含有2个Turn(临界值2.4)位点、7个抗原倾向(临界值1.9)位点、14个表面可及性(临界值1.9)位点、12个暴露表面(临界值2.3)位点,以及3个B细胞表位、7个限制性CTL细胞表位、9个限制性Th细胞表位;STRING分析显示,与该蛋白片段互作的隐孢子虫蛋白有10个. 结论 隐孢子虫CpPRP1 Sushi结构域蛋白片段具有良好的免疫原性,可成为潜在的隐孢子虫病疫苗候选分子.
其他文献
摩机,烧友们均认为能改善音质,但音质能改善多少呢?有的人在报刊上大侃“像换了一台新机一样”,“低音有力、泛音丰富”等等,也有人撰文感叹“效果似有耳闻”,“简直怀疑此
芹菜中农药残留超标问题已引起国内外的广泛关注,为探讨芹菜中农药残留行为,选择小白菜为对照蔬菜,在大棚中开展芹菜中毒死蜱和多菌灵残留降解动态研究.试验结果表明,在相同
目的 构建鸟分枝杆菌PPE25-MAV蛋白的重组质粒并诱导表达和纯化,观察其对Ana-1系巨噬细胞凋亡的影响.方法 在GenBank中查找到鸟分枝杆菌编码PPE25-MAV蛋白的MAV-2928基因序列
今年南京紫金山天文台的天文工作者借助天文望远镜将一次次慧星撞木星的天象记录下来,由中央电视台向全国和世界作了精彩报导。这一幅幅十分珍贵的电视屏幕图象就是采用敏通
煤工尘肺是严重危害煤矿工人健康的一种职业病,是一种慢性进展性、不可逆的呼吸系统职业病,在煤工尘肺的进展过程中,容易并发多种并发症而使病情恶化以至死亡,特别是煤工尘肺
不同小麦产区、不同播种时间小麦播种量差异较大,对吡虫啉拌种防治小麦蚜虫具有较大的影响.研究结果表明:吡虫啉拌种防治小麦蚜虫具有优异的防治效果和超长的持效期,在整个麦
目的 分析2012-2018年人与骆驼来源的中东呼吸综合征(MERS-CoV)的密码子偏爱性关系.方法 使用ENC-Plot、中型绘图、PR2绘图、聚类分析等方法对MERS-CoV各蛋白编码序列进行分
随着设施蔬菜生产的发展，加上自然气候变化、植物品种变更等原因，近年来蔬菜新的病虫害不断出现，如番茄黄化曲叶病毒病、黄瓜靶斑病等，严重威胁了蔬菜的安全生产。为有效防控大棚
医疗器械是为患者提供诊断、治疗必不可少的工具,本文通过对医疗器械生锈原因的分析与防锈措施的探讨,为器械的保养提供了有益的经验。
Medical equipment is to provide pa
目的 重组表达棘阿米巴热休克蛋白20(Heat shock protein 20,HSP20),并对HSP20作为疫苗候选分子的免疫活性进行验证.方法 以棘阿米巴滋养体cDNA为模板,PCR扩增HSP20基因,构建