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中医辨证论治思维的研究方法具有原创性,其代表性有取象运数、变易求和、整体思维及模糊性思维、发散性思维、直觉性思维、想象性思维等其它方法。其特点主要包括相关性、动态性、模糊性、涌现性及直觉、体悟;重时间而轻空间;往复循环;中医思维的通识性等。中医辨证论治思维研究的发展方向是以"我主人随"为标识的自主思维模式,是引领未来医学思维发展的主要方向;中医药学是"中国科学学派"的带头学科;中医药的原创思维方法是医学科研的通途;宇宙观是思维的最高级层次。