【摘 要】
:
目的:了解重庆地区健康无偿献血人群的微生物组,并调查可能存在的新发/再发病原体的流行情况,本研究利用深度测序的方法对重庆地区5 000人份健康无偿献血者标本进行了宏基因组学分析,以鉴定其中的新发/再发病原体.方法:提取5000人份血浆核酸总DNA,经随机引物扩增后,建库上机深度测序,用本课题组开发的KrakenPy软件分析宏基因组数据,并确定其中的微生物组,鉴定可能存在的新发/再发病原体.结果:通
【机 构】
:
中国医学科学院北京协和医学院输血研究所,四川成都610052 重庆市血液中心
论文部分内容阅读
目的:了解重庆地区健康无偿献血人群的微生物组,并调查可能存在的新发/再发病原体的流行情况,本研究利用深度测序的方法对重庆地区5 000人份健康无偿献血者标本进行了宏基因组学分析,以鉴定其中的新发/再发病原体.方法:提取5000人份血浆核酸总DNA,经随机引物扩增后,建库上机深度测序,用本课题组开发的KrakenPy软件分析宏基因组数据,并确定其中的微生物组,鉴定可能存在的新发/再发病原体.结果:通过深度测序将获得的1.23 Gb的数据,其中包括2 146 844个有效读长,去人类DNA背景后,结果显示属于细菌的片段47条,属于病毒的片段21条,属于寄生虫的片段333条.最主要的病原体是刚地弓形虫(Toxoplasma gondii),其次是欧猥迭宫绦虫(Spirometra erinaceieuropaei),仅发现少量指环病毒科(Anelloviridae)的病毒成员如扭转病毒Torque teno vi-rus等.另外,我们还发现在欧美发达国家已经被认为是能够造成输血安全威胁的病原体DNA片段,如疟原虫(Plasmodium spp.),婴儿利什曼原虫(Leishmania infantum)等.结论:本研究结果:显示了重庆地区健康无偿献血人群的微生物组结构,同时也揭示了这些健康献血者有可能携带的新发/再发病原体,提醒采供血系统工作者应结合当地新发传染病流行情况,合理的制定疫区或是传染病流行季节的筛查模式和献血者招募策略.另外,对于这些潜在风险也不必过于惊慌,因为这仅是微生物基因组片段结果,不代表该病原体仍具有感染性.
其他文献
在政治与经济版图上,女性已经不再缺席,而且席位呈现出了递增之势。于是,在每年的各种榜单中,“女富豪榜”“全球最具影响力女性榜”“权势女性榜”等等,已经成了必出的榜单
低影响发展模式(Low impact development,简称LID)是1990年代末在暴雨管理和面源污染处理技术基础上发展起来的城市雨洪水综合管理的设计与工程方法,它继承了传统BMPs技术优
Lipid microtubules with wound ribbon features were fabricated by self-assembling method, and the deposition patterns of colloidal Pd particles on tubular templa
“爱祖国,爱人民,心中有集体,心中有他人”是雷锋精神的重要体现。用雷锋精神培育一代新人是广州市海珠区万松园小学开展学雷锋活动的宗旨。学校自1964年创办起,就坚持开展学
混凝土是建筑工程中应用最广泛的材料,无损检测对于保证混凝土质量起到极其重要的作用。本文介绍了混凝土无损检测的主要方法及其特点,分析了混凝土无损检测发展趋势。
Conc
关于 MAN-B&W 公司于1991年推出其提高功率的 MC 机,已作了许多设计更改,特别在燃烧室区域。与较早期的 MC大缸径机作比较,较厚的缸盖使其与缸套之间的接合面低于上死点位置
小朋友们都很喜欢吃菠萝,但是刚削(xiāo)好的菠萝如果直接吃的话,就会感觉嘴巴发麻。所以,每次吃菠萝前,妈妈都会将菠萝用盐(yán)水泡一下,这样吃起来就更甜了。你知道这是
为了使学生在语文学习中充满积极性,让学生在课堂教学中充当语文学习的主人,通过“激发、引导、培养、实践”八字教学模式培养学生的兴趣,发挥学生主体作用,来提高教学质量。
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。
Please download to view, this article does not support online access to view profile.
日前,武宁县第二小学在学校操场举行“诵读国学经典”比赛,全校30个班级分年级层层选拔出来的40名学生一一登台亮机,用稚嫩的声音诵读“人之初、性本善”等国学启蒙经典。全