【摘 要】
：
蛋白质的氨基酸序列如何决定空间结构是当今生命科学研究中的核心问题之一.折叠类型反映了蛋白质核心结构的拓扑模式,折叠识别是蛋白质序列.结构研究的重要内容.我们以占Astr
论文部分内容阅读
蛋白质的氨基酸序列如何决定空间结构是当今生命科学研究中的核心问题之一.折叠类型反映了蛋白质核心结构的拓扑模式,折叠识别是蛋白质序列.结构研究的重要内容.我们以占Astral 1.65序列数据库中α,β和α/β三类蛋白质总量41.8%的36个无法独市建模的折叠类型为研究对象,选取其中序列一致性小于25%的样本作为训练集,以均方根偏差(RMSD)为指标分别进行系统聚类,生成若干折叠子类,并对各子类建立基于多结构比对算法(MUSTANG)结构比对的概形隐马尔科夫模型(profile-HMM).将Astral 1.65中序列一致性小于95%的9505个样本作为检验集.36个折叠类型的平均识别敏感性为90%,特异性为99%,马修斯相关系数(MCC)为0.95.结果表明:对于成员较多,无法建市统一模型的折叠类型,基于RMSD的系统分类建模均可实现较高准确率的识别,为蛋白质折叠识别拓展了新的方法和思路,为进一步研究奠定了基础.
其他文献
Three derivatives of dehydroabietylamine were synthesized from dehydroabietylamine through trifluoro-acetyltion, nitration and hydrolysis. Two of them were firs
基于独立成分分析(ICA)方法分析水平管气液两相流的电阻成像(ERT)所获取数据,提取水平管气液两相流流动特征,获取分相信息.通过分析比较ICA所得的独立分量以及ERT侧视、俯视
在常压、298.15 K条件下,用RD496-2000微热量仪分别测量了1,3,3-三硝基氮杂环丁烷(TNAZ)在乙酸乙酯(EA)和N,N-二甲基甲酰胺(DMF)中的溶解焓.得到了TNAZ在不同溶剂中的微分溶
以乙基黄酸锌(ZnR_2)作为单分子前驱体,SBA-15作为模板,合成高度有序的ZnS纳米束,并通过透射电子显微镜(TEM)、热重一差热分析(TG-DTA)、X射线衍射(XRD)、N_2吸附.脱附、紫外
礼县高寺头遗址,位于礼县县城西南9公里处的石桥乡高寺村西南部的小山坡上,原称之为“礼县石桥镇遗址”.1986年,由甘肃省文物考古研究所组成考古队进行了发掘.同时,对该遗址
2010年6月,甘肃合水县肖咀乡发现了一座唐代墓葬,经发掘,该墓为唐初右监门卫将军魏哲之墓.墓中出土一方墓志,明确记载了魏哲的生平等,是陇东地区正式发掘的唐墓,丰富了甘肃唐
为提高Bézier曲线降阶的稳定性,提出以基于L2范数的逼近误差为指导的一种迭代算法.该算法从一条初始Bézier曲线开始逐渐地对其控制顶点进行偏移,得到具有误差最小的逼近曲线;同时,应用线性搜索方法来优化控制顶点的偏移,使得在每次迭代后逼近误差可以达到局部最小.实例结果表明了该算法的快速收敛性.
报道了在含氟的酸性水溶液中,对电沉积制备的WO_3薄膜电极进行电化学刻蚀,并采用光电化学、扫描电子显微镜(SEM)、X射线衍射(XRD)、光电子能谱(XPS)、紫外-可见漫反射光谱、
氟表面活性剂的环境和生物降解问题是最近的热点,特别是全氟长链(≥C_8)氟表面活性剂的应用限制乃至禁用已成为必然趋势.本文合成了一种以短链的全氟丁基为基础的阳离子氟表
研究了一条新的路线用于他汀类药物的重要中间体(R)-4-氰基-3-羟基丁酸乙酯的合成.以廉价、易得的L-(一)-苹果酸为起始原料,经酯化、还原、溴代和氰化四步反应得到目标化合物