【摘 要】
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[目的]研究Rif1通过BMP4信号传导通路影响小鼠胚胎干细胞自我更新和分化的作用机制.[方法]从基因表达数据库中下载基因芯片数据(GSE 55129),采用R软件包分别对长期、短期干扰
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[目的]研究Rif1通过BMP4信号传导通路影响小鼠胚胎干细胞自我更新和分化的作用机制.[方法]从基因表达数据库中下载基因芯片数据(GSE 55129),采用R软件包分别对长期、短期干扰Rif1后的表达谱数据做预处理并筛选差异基因.取长期干扰Rif1的差异基因进行KEGG分析,采用RT-qPCR对KEGG结果进行验证,取短期干扰Rif1的差异基因进行GO分析,选择与胚胎发育有关的基因整合到相关的KEGG通路中.[结果]KEGG分析结果显示,Rif1与TGF-β(BMP4)信号传导通路高度相关(P<0.01);RT-qPCR验证结果证实BMP4表达明显升高(P<0.05);GO分析结果与活化BMP4通路后的效应相一致.[结论]Rif1通过BMP4信号传导通路影响小鼠胚胎干细胞的自我更新和分化.
[Objective] To study the mechanism of Rif1 affecting the self-renewal and differentiation of mouse embryonic stem cells through the BMP4 signal transduction pathway. [Methods] Gene chip data (GSE 55129) was downloaded from the gene expression database and the R software package was used to analyze the long- Rif1 gene expression profile of pretreatment and screening of differential genes.From the long-term interference Rif1 differential gene KEGG analysis using RT-qPCR KEGG results were verified by short-term interference Rif1 differential gene GO analysis, selection and embryonic development (P <0.01). The results of RT-qPCR showed that the expression of BMP4 was significantly increased (P <0.01). The results of RT-qPCR showed that the expression of BMP4 was up-regulated P <0.05). The results of GO analysis were consistent with those of activated BMP4 pathway. [Conclusion] Rif1 affects the self-renewal and differentiation of mouse embryonic stem cells through BMP4 signaling pathway.
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