2013-2017年中山市20起诺如病毒暴发疫情的分子流行病学特征分析

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目的 分析2013-2017年间中山市诺如病毒暴发疫情的分子流行病学特征,为中山市诺如病毒感染疫情防控提供分子生物学实验依据.方法 收集2013-2017年间中山市20起诺如病毒引起的感染性腹泻暴发疫情病例标本,采用RT-PCR方法测定诺如病毒VP1基因全序列,并对序列进行系统发育分析.结果 20起诺如病毒引起的感染性腹泻暴发主要发生在幼儿园及小学,占疫情总数的80.0%(16/20).获得了77株病毒的VP1基因全序列,20起疫情分别由GⅡ.4 Sydney_2012(25.0%,5/20),GⅡ.3(25.0%,5/20),GⅡ.17(25.0%,5/20),GⅡ.2(15.0%,3/20),GⅡ.21(5.0%,1/20),及GⅡ.6(5.0%,1/20)亚型引起,5起暴发中GⅡ.4 Sydney_2012分为两个不同分支.结论 GⅡ.17型为中山市新发现流行毒株,2016年底发现的两起GⅡ.4Sydney_2012区别于以往出现GⅡ.4Sydney_2012,可能为新亚型的重组毒株(GⅡ.P16-GⅡ.4 Sydney_2012).VP1基因序列分析可作为有效的诺如病毒分型工具,RdRp基因分析应作为重要补充以确定毒株的重组变异情况.
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