【摘 要】
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为探究沙棘属植物种间叶绿体全基因组的序列特征和系统发育关系，本研究从NCBI数据库下载6个沙棘属植物叶绿体全基因组序列，利用IRscope和REPuter等生物信息学工具，对江孜沙棘、柳叶沙棘、西藏沙棘、棱果沙棘、肋果沙棘和中国沙棘等6种沙棘属植物叶绿体全基因组的序列特征及系统发育关系进行了分析。结果表明：6种沙棘属植物的叶绿体全基因组大小在155 260～156 316 bp之间，均为四分体结构
【基金项目】
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陕西省科技厅重点研发项目农业领域一般项目（2022NY-147）； 陕西省教育厅服务地方专项科研计划项目（22JC065）； 陕西省林业科技创新计划专项经费资助（SXLK2021-0236）； 榆林市林业产业开发中心横向课题（2020HX66）； 榆林市高新区科技
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为探究沙棘属植物种间叶绿体全基因组的序列特征和系统发育关系，本研究从NCBI数据库下载6个沙棘属植物叶绿体全基因组序列，利用IRscope和REPuter等生物信息学工具，对江孜沙棘、柳叶沙棘、西藏沙棘、棱果沙棘、肋果沙棘和中国沙棘等6种沙棘属植物叶绿体全基因组的序列特征及系统发育关系进行了分析。结果表明：6种沙棘属植物的叶绿体全基因组大小在155 260～156 316 bp之间，均为四分体结构，包括大单拷贝区（LSC）、小单拷贝区（SSC）和两个反向重复区（IRs）；注释基因含94～134个，其中蛋白编码基因85～88个，tRNA基因除柳叶沙棘含39个外，其余5种沙棘属植物均含38个，rRNA基因均有8个。6种沙棘属植物的叶绿体全基因组共检测到608条重复序列，包括29条串联重复序列、279条散在重复序列和300条回文重复序列；共搜索到535个简单重复序列（SSRs）位点，其中单核苷酸重复个数占比最多，为74.02%。通过近邻结合法（NJ）对6种沙棘属植物和2种胡颓子属植物（大叶胡颓子和翅果油树）的叶绿体全基因组构建系统进化树发现，6种沙棘属植物亲缘关系相近，其中，肋果沙棘、中国沙棘和棱果沙棘间的亲缘关系更近，江孜沙棘和柳叶沙棘的亲缘关系更近。该研究结果为沙棘属种间界定划分提供新的资料和理论基础，同时为该物种的演化过程以及分类学地位提供科学依据。
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