【摘 要】
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目的筛选与变异链球菌(变链菌)生物膜形成相关的小RNA(small noncoding RNAs,sRNAs),并初步探索其功能。方法通过实时定量荧光PCR比较变链菌sRNAs在浮游态和生物膜状态下的差
【机 构】
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中山大学光华口腔医学院·附属口腔医院;
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目的筛选与变异链球菌(变链菌)生物膜形成相关的小RNA(small noncoding RNAs,sRNAs),并初步探索其功能。方法通过实时定量荧光PCR比较变链菌sRNAs在浮游态和生物膜状态下的差异表达,筛选与变链菌生物膜形成相关的sRNAs;采用激光共聚焦扫描显微镜检测变链菌生物膜形成期间的特征变化;应用生物信息学方法来预测生物膜相关sRNA的靶基因及其可能参与的调节通路,并分析sRNA与致龋特性相关靶基因的关系。结果与变链菌浮游态相比,sRNA0426在变链菌UA159生物膜中显著上调,其表达随着生物膜形成的进展而变化;相关性分析结果表明,在变异链球菌临床株中sRNA0426的表达水平与生物膜形成和胞外多糖呈正相关;sRNA0426可能参与变链菌八条调控通路,其中多条通路与变链菌的生物膜形成相关;在12h生物膜中,sRNA0426的表达与胞外多糖相关靶基因gtfBC,ccpA的表达呈正相关,与comE呈负相关。结论变链菌中存在与生物膜形成相关的sRNAs;sRNA0426可能通过影响变链菌胞外多糖的合成从而调控生物膜的形成,是一个潜在的变链菌生物膜调控因子。
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