【摘 要】
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直链淀粉含量是稻米蒸煮食味品质的主要决定因素之一。水稻中Wx基因编码的颗粒结合淀粉合酶(GBSS)负责稻米中直链淀粉的生物合成，Wx基因的多态性及其表达调控是造成不同水稻品种间直链淀粉含量差异的主要原因。本研究利用从网上收集的104个不同水稻品种的Wx基因序列进行比对，除基因前导区的(CT)n多态性和和第1内含子中的(AATT)n多态性外，在其CDS序列（共1830bp）中还检测到90个SNP位点
【机 构】
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江西农业大学农学院,江西南昌 330045
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直链淀粉含量是稻米蒸煮食味品质的主要决定因素之一。水稻中Wx基因编码的颗粒结合淀粉合酶(GBSS)负责稻米中直链淀粉的生物合成，Wx基因的多态性及其表达调控是造成不同水稻品种间直链淀粉含量差异的主要原因。本研究利用从网上收集的104个不同水稻品种的Wx基因序列进行比对，除基因前导区的(CT)n多态性和和第1内含子中的(AATT)n多态性外，在其CDS序列（共1830bp）中还检测到90个SNP位点。90个SNP位点中，9个（+220,+221,+497,+671,+770,+1086,+1243,+1690,+1818）为简约信息位点，其中1个（+220）为3碱基（G/T/C）变异，其余为二分等位变异。9个简约位点中，7个为错义SNP（+220,+221,+497,+671,+770,+1243和+1690），2个为同义SNP（+1086,+1818），其中+220和+221属同一密码子。利用引物RM190、RMD21，并对存在错义突变的cSNP位点利用PCR一步法设计引物，对105个不同直链淀粉含量的水稻品种进行了检测。结果表明，(CT)n共有6种多态性（(CT)19,(CT)18,(CT)17,(CT)16,(CT)10和(CT)8），其中(CT)8、(CT)10多为高直链淀粉含量品种，(CT)19、(CT)18多为中等或低直链淀粉含量品种，(CT)17多为中等或高直链淀粉含量品种，(CT)16全为糯稻品种；(AATT)n共有2种多态性（(AATT)5和(AATT)6），其中(AATT)6的品种多为高直链淀粉含量，(AATT)5的品种多属低等和中等直链淀粉含量。+1243位点存在的C/T多态性与稻米直链淀粉含量有明显的相关性，该位点为C的品种多为低等和中等直链淀粉含量，为T的品种多数为高直链淀粉含量；+497位点的A/G多性态也与稻米直链淀粉含量存在一定的关系，该位点为G的品种均为低直链淀粉含量。
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