为解析芝麻对湿害胁迫的反应特征,分离关键基因,对耐湿基因型ZZM2541和敏感基因型鄂芝2号在湿害胁迫不同时间点(分别为淹水前,淹水3h、9h和15h,撤水后20h)的基因表达进行分析。结果发现,胁迫使两种基因型的基因表达都受到抑制,且随胁迫时间延长被抑制的基因数增多。两种基因型中,上调基因的数量在0 ～9h逐渐减少,而后逐渐增加,但下调基因的数量在0～ 15h逐渐增多,而后减少；两种基因型在湿害胁迫0 ～9h差异表达基因逐渐减少,在15h及撤水后,两种基因型间的差异表达基因明显增多,但在整个过程中,耐湿材料上调基因的数量高于敏感材料,下调基因的数量少于敏感材料。初步推测淹水9h为不同材料对胁迫适应性反应的临界点,在此时间点,ZZM2541相对鄂芝2号的差异表达基因显著富集在苯丙烷合成、苯基丙氨酸代谢、次级合成代谢、内质网蛋白加工等pathway上,这些pathway的活性可能与芝麻耐湿性有关,对这些代谢通路上重要基因的分析为发掘耐湿关键基因提供了参考。