通过Atlas Human Select Tumor Array分析了肝癌、肺癌、前列腺癌、膀胱癌和乳腺癌中差异表达的基因在鼻咽癌中的表现。膜上共发现鼻咽癌组织差异表达的基因115种。其中68种基因有可能成为肿瘤细胞共同的分子标志物,在肿瘤的发生和发展中起十分重要的作用,47种基因有可能成为鼻咽癌特异的分子标志物。同时,通过与CGH数据的综合比较研究,发现染色体片段的扩增争缺失可能是有些基因表达改变的原因。对照不同病理分期鼻咽癌惠者CGH资料的特点,发现位于1q,6q,8p的基因LBR,S100A8,PROL2,SFTPC,它们的扩增发生在鼻咽癌的中晚期,9q的基因RPL7A,它缺失也发生在鼻咽癌的中晚期,因此,它们可能成为中晚期鼻咽癌的分子标志物；位于11q的RPS25的缺失在鼻咽癌早期即可发生,可用于早期鼻咽癌的筛查,可望成为早期鼻咽癌的分子标志物。而与胃癌CGH资料对比研究的结果,提示鼻咽癌患者3p,11q,16q和13q的缺失可能与EBV感染和作用相关,为EBV与鼻咽癌发生的关系提供了间接的证据。