【摘 要】
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提取草鱼肝脏总RNA,采用RT-PCR和RACE方法扩增草鱼乙酰辅酶A羧化酶(ACC)基因的核心序列、3′末端和5′末端序列,克隆测序,将各片段序列组装得到草鱼ACC基因全长cDNA序列,并对所得到的序列进行生物信息学分析.结果表明,草鱼ACC基因的全长cDNA序列共7433bp,开放阅读框共7071bp,共编码2357个氨基酸.推测前28个氨基酸构成一个信号肽,编码的蛋白是非分泌蛋白,蛋白分子量
【机 构】
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淮海工学院,江苏省海洋生物技术重点实验室,江苏连云港222005
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提取草鱼肝脏总RNA,采用RT-PCR和RACE方法扩增草鱼乙酰辅酶A羧化酶(ACC)基因的核心序列、3′末端和5′末端序列,克隆测序,将各片段序列组装得到草鱼ACC基因全长cDNA序列,并对所得到的序列进行生物信息学分析.结果表明,草鱼ACC基因的全长cDNA序列共7433bp,开放阅读框共7071bp,共编码2357个氨基酸.推测前28个氨基酸构成一个信号肽,编码的蛋白是非分泌蛋白,蛋白分子量为265KDa,等电点为6.27,pH7.0时带26.414个负电荷.该氨基酸序列与斑马鱼的相似性为96％,基于不同生物ACC氨基酸序列构建了系统发育树,发现ACC序列在脊椎动物中很保守,相似性相当高.
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利用19对EST-SSR引物对不同来源草鱼5个群体进行遗传多样性分析,结果表明：(1)19对引物均获得了预期的扩增结果,得到了93个多态性位点,每对引物检测到的等位基因数为2～8个,平均为4.89个.(2)每个群体的平均等位基因数(Na)是3.5263～4.3158,平均有效等位基因数(Ne)是1.9996～2.1390,平均观察杂合度(Ho)是0.4592～0.5013,平均期望杂合度(He)是
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