【摘 要】
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为准确、快速鉴定中药材海风藤及其混伪品,保证临床用药安全,考察DNA条形码对海风藤及其混伪品的鉴定能力,本研究对matK, rbcL, ITS2和psbA-trnH序列进行PCR扩增,双向测序后对数据进行CodonCodeAigner处理,利用Muscle进行序列比对,MEGA 5.2.2计算K2P遗传距离并建立系统进化树,TAXON DNA计算bar-coding gap,并基于PHR开源代码生
【出 处】
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2016年中国农业工程学会农产品加工及贮藏工程分会学术年会
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为准确、快速鉴定中药材海风藤及其混伪品,保证临床用药安全,考察DNA条形码对海风藤及其混伪品的鉴定能力,本研究对matK, rbcL, ITS2和psbA-trnH序列进行PCR扩增,双向测序后对数据进行CodonCodeAigner处理,利用Muscle进行序列比对,MEGA 5.2.2计算K2P遗传距离并建立系统进化树,TAXON DNA计算bar-coding gap,并基于PHR开源代码生成二维DNA条形码,旨在筛选出鉴定海风藤及其混伪品的最佳条形码.结果 表明：matK序列的扩增率、测序成功率及序列获得率序列为10.5％、75％和7.9％,rbcL序列为89.5％、8.8％和7.9％,ITS2序列为86.8％、3.0％和2.6％,psbA-trnH序列为100％、100％和100％；海风藤的种内遗传距离为0,种间遗传距离为0.004-0.426,形成明显的barcoding gap；聚类分析结果表明海风藤及其混伪品各聚一支；同时二维DNA条形码使得药材鉴定更加简便.综上所述psbA-trnH是海风藤及其混伪品鉴定的最佳条形码.
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