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随着科学技术的发展，产生了许多复杂的工程活动和复杂工程系统。复杂工程系统的要素十分庞杂，要素之间的非线性相互作用很强，系统表现出自组织和涌现的特征。同时，复杂工程系统作为人工系统，又体现出其目的性和人工性。我们需要在自组织与他组织的纠缠中分析复杂工程系统的自组织特征。本文从开放性、系统模式、自组织演化动力、涨落与分叉及动态演化等几个方面来展开分析。鉴于复杂工程系统自身的特殊性，需要从工程哲学的角度对其自组织问题进行新的阐释。