甘薯基因组概览分析及重要功能基因挖掘

来源 :2015中国遗传学会大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lurenjia1983
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  甘薯[Ipomoea batatas(L.) Lam]是世界第7大粮食作物,它高产稳产、营养丰富且环境适应性极强,能够种植于干旱贫瘠土壤,投入产出比高且用途广泛,是一种重要的粮食、饲料和工业原料作物.甘薯栽培品种是6倍体,基因组庞大(2,200-3,000 Mb,2n=6x=90)且无性繁殖,具有自交不亲和性.与其他作物相比,甘薯的遗传研究工作进展缓慢.除已有的几个甘薯转录组数据库外,目前尚无基因组数据.因此,需要大量组学数据资源来填补甘薯无基因组信息的空白.甘薯基因组概览分析是通过对甘薯基因组进行低覆盖度的小片段测序和组装,进而分析其基因组大小、重复性及杂合程度.另外,甘薯基因组数据库的构建有利于从中挖掘多种具有重要功能的基因信息.
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