【摘 要】
：
微卫星标记技术(SSR)在植物种质资源多样性研究及分子育种等方面的应用越来越广泛.高通量测序技术的发展使SSR标记开发更为快速且低成本.笃斯越桔为杜鹃花科越橘属多年生落叶灌木,果实富含花青素和黄酮类物质,有很高的营养价值和经济价值.利用SSR标记对笃斯越桔野生种质资源的研究尚未见报道.本研究以笃斯越桔成熟果实为材料,利用高通量测弃技术进行转录组测序,共获得34.62Gb Clean Data, Q
【机 构】
：
延边大学农学院,吉林延吉,133002
【出 处】
：
第六届全国果树分子生物学学术研讨会
论文部分内容阅读
微卫星标记技术(SSR)在植物种质资源多样性研究及分子育种等方面的应用越来越广泛.高通量测序技术的发展使SSR标记开发更为快速且低成本.笃斯越桔为杜鹃花科越橘属多年生落叶灌木,果实富含花青素和黄酮类物质,有很高的营养价值和经济价值.利用SSR标记对笃斯越桔野生种质资源的研究尚未见报道.本研究以笃斯越桔成熟果实为材料,利用高通量测弃技术进行转录组测序,共获得34.62Gb Clean Data, Q30碱基百分比在88.73％以上,经过组装共得到89725条Unigenes,其中lkb以上Unigenes 20473条,占22.82％.用MISA软件对1kb以上的Unigenes进行SSR分析和引物设计,结果表明：共获得SSR位点10264个,包括单碱基重复3 135个,二碱基重复5485个,三碱基重复1554个,四碱基重复67个,五碱基重复8个,六碱基重复15个.二核苷酸重复中,AG/CT比例最高(4869个,占47.4％),CG/CG比例最低(15个,占0.15％).三核苷酸重复中,AAG/CTT比例最高(442个,占4.30％),ACT/AGT比例最低(24个,占0.23％).设计并合成了210对引物,采用PCR方法对引物进行有效性检测,共筛选出72对条带清晰且与目的片段大小相符的引物.以来自不同野生居群的5个样本为材料,筛选出25对具有较强多态性的引物,多态性百分率为1 1.9％.本研究所得信息丰富了笃斯越桔的分子标记种类,为笃斯越桔的种质资源多样性的研究奠定了坚实基础.
其他文献
以银杏叶为试验材料,利用RACE和RT-PCR技术获得HMGS基因cDNA全长序列(命名为GbHMGS)；序列分析表明,GbHMGS基因的cDNA全长为1941bp,包含一个1416bp长的开放阅读框,编码471个氨基酸；蛋白质分子量和等电点分别为52.3kDa和5.36.二级结构分析表明,无规则卷曲和α-螺旋结构占较多比例.氨基酸序列多重比对显示,GbHMGS蛋白质与其他植物的HMGS蛋白具有高
白藜芦醇是一种含有芪类结构的非黄酮类多酚化合物,对人体具有很重要医学保健作用.外源脱落酸(abscisic acid, ABA)处理葡萄果实可以诱导果实成熟及果皮中白藜芦醇(resveratrol,Res)的合成,但是ABA、始熟期及花色苷与Res的积累三者之间的关系并不清楚.本研究通过外源ABA及其合成抑制剂氟啶酮(Fluridon)处理不同发育时期“北红”(“玫瑰香”ד山葡萄”)葡萄果实,旨
乙酰辅酶A转移酶和甲羟戊酸激酶是萜类合成MVA路径的关键酶,以银杏(Ginkgo Biloba L.)家佛手叶片为实验材料,根据转录组数据设计引物,获得了银杏的AACT和MVK基因cDNA序列,分别命名为GbAACT和GbMVK,序列分析结果表明：GbAACT基因开放阅读框1215bp,编码404个氨基酸,GbMVK基因开放阅读框1194bp,编码397个氨基酸,分别与与橡胶树(Hevea bra
石榴果实营养丰富,具有鲜食、加工及药用价值.由于石榴资源的长期无性扦插、嫁接繁殖和人为的偏好选择,使石榴的基因型趋向单一,导致遗传多样性降低,品种退化现象严重,直接影响到果实的产量和品质.为拓宽石榴种质的遗传基础,有效开展远源杂交育种进行种质创新,本研究用ISSR技术研究了65个石榴品种的遗传多样性和亲缘关系.结果 显示ISSR引物多态性位点比率(PPB)为86.56％,表明ISSR标记能有效研究
通过测定套塑膜袋、无纺布袋及不套袋茌梨果实果皮的果点大小及数目、木质素含量、可溶性糖含量等生理指标，结合发育期果实果皮数字基因表达谱和相关基因表达量，探究两种套袋处理对茌梨果实外观品质的影响。结果 表明，与不套袋果实相比，套塑膜袋及无纺布袋果实果皮中分别检测到3022和769个差异表达基因；基因本体(Go)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析表明，注释到光合天线蛋白及光合作用代谢通路的差
为探究柑橘果实柠檬酸的降解机制,以盛花后120天的靖安椪柑果实为材料,研究了40℃热空气处理48 h对果实有机酸含量及柠檬酸代谢相关基因表达的影响。结果 表明：40℃热空气处理48h能显著增加果实失重率和总糖含量,对CCI和TSS含量无显著影响；而果实有机酸含量特别是柠檬酸含量经热空气处理后显著降低。基因表达结果表明,热处理诱导CitCS1和CitCS2基因表达上调,其中CitCS1表达与对照达显
以全红型软枣猕猴桃天源红为试材,同种绿肉软枣猕猴桃永丰一号为对照样品进行转录组测序,获得202,742条unigenes,平均长度为603bp,N50长度为873bp.确定12个明显差异表达的结构基因,利用实时荧光定量PCR对这12个差异结构基因在8个时期果肉样品中的表达情况进行分析,同时测定了这8个时期果肉的色泽比、色度角以及花色苷含量这三种生理指标.结果 表明,12个结构基因在8个时期均有表达
菠萝自然开花受外界环境因素影响较大,在开花时间、开花率等方面都具有较大的不确定性。因此在商业化生产中通常采用乙烯利进行诱导菠萝开花,可明显提高开花的整齐度和开花率,有效调节菠萝上市时间。在植物体内乙烯可以调控一系列衰老相关的基因,同时乙烯在诱导开花的过程中也扮演着复杂多变的角色,而关于乙烯诱导菠萝花芽分化的分子机理却知之甚少。本研究采用RNA-Seq技术,进行了乙烯利诱导下菠萝品种台农16号转录组
以贵农5号刺梨(Rosa roxburghii TrattGuinong 5)为试材,采用果实离体喂饲的方法研究外源SA和MJ对刺梨果实AsA合成的影响,结果表明：2.0 mmol·L-1 SA对刺梨果实AsA的合成有显著的促进作用,而刺梨果实在经过16 h 10-2 mmol·L-1 MJ喂饲后,AsA的合成量降低.对外源SA和MJ处理下刺梨果实AsA合成相关基因表达水平进行实时荧光定量PCR
以着色嘎拉和非着色金冠两个品种苹果果皮为试材提取总蛋白,用TiO2富集磷酸化肽段,对富集到的磷酸化肽段进行高效液相色谱分离,利用质谱鉴定磷酸化肽段,采用Mascot2.2和Proteome Discoverer1.4 (thermo)软件进行蛋白质查库鉴定,使用的数据库为Uniprot_ Maloideae.fasta.对鉴定到的磷酸化肽段和蛋白质进行分析,找出着色与非着色苹果品种中有差异的磷酸化