基于TCGA数据挖掘分析ITGAL在肺腺癌预后与免疫微环境中的作用及意义

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chenrg210
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目的:探究RANK/RANKL信号通路相关基因ITGAL在肺腺癌预后的临床意义及在免疫微环境中的作用。方法:利用KEGG数据库收集RANK/RANKL相关通路基因。基于TCGA肺腺癌数据库进行基因差异表达分析。根据Kaplan-Meier曲线和临床相关特征确定最终筛选基因为ITGAL。利用Cox风险回归模型对总生存期(OS)进行单因素和多因素分析。再对ITGAL基因进行通路富集分析。最后使用CIBERSORT和TIMER的相关模块探讨了ITGAL与肿瘤免疫浸润的相关性。结果:KEGG数据库收集RANK/RANKL相关通路基因618个。对TCGA数据库中肺腺癌样本进行生物信息学分析并且结合临床筛选出ITGAL基因。ITGAL在肿瘤组织中的表达量明显增高(P<0.05),并且ITGAL的高表达与较好的OS相关(P<0.05)。Cox回归分析提示ITGAL可以作为肺腺癌患者的独立预后因素(P<0.05)。基因富集通路显示:ITGAL高表达的样本主要富集于免疫相关信号通路。而ITGAL低表达的样本则主要富集以代谢通路为主的通路。进而利用CIBERSORT和TIMER数据库对ITGAL进行分析,提示ITGAL与肿瘤浸润性免疫细胞如CD8+T细胞、CD4+T细胞、Treg细胞等有很强的相关性,进而影响肺腺癌的免疫微环境。结论:ITGAL是肺腺癌预后的生物标志物,能够影响肺腺癌的免疫浸润,可能是RANK/RANKL信号通路上肺腺癌免疫治疗的潜在预测因子。
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