当前,跨境交易活动呈现出参与主体多样化的特征,其中合伙企业作为活跃的交易主体对跨境经济的繁荣发展做出了重要贡献。然而,合伙企业在跨境交易中的税收待遇却因各国对其身份的认定存在差异而饱受争议。同一家合伙企业可能在一国被认为是税收透明体,在另一国却被认为是税收实体,这使得合伙企业跨境所得的税收问题变得相当复杂。同时,尽管OECD关注了该争议并发布合伙企业报告对合伙企业的协定适用问题提出建议,但目前大部分协定并未具体明确合伙企业的协定资格,这导致合伙企业的跨境所得涉税问题更为复杂。对于境外合伙企业境内所得的税收问题,我国在国内法和税收协定中都做出了相关规定,但是现行政策规定在征税模式和协定适用规则两方面都存在一定的问题,与OECD的建议存在较大差异。因此,分析境外合伙企业境内所得的现行政策并提出完善建议具有重要的理论和现实意义。本文首先对合伙企业征税模式的基本理论进行研究,运用理论分析法分析三种征税模式的内涵及其利弊,进而从征税模式和协定适用两方面对我国合伙企业相关所得税政策的发展进程和政策现状进行梳理和研究,提出我国现行政策存在以下问题:在征税模式方面,现行政策不符合集合体理论、违背税收公平原则和税收中性原则;而在协定适用规则方面,现行政策违背非歧视原则且我国签订的税收协定中合伙企业的相关条款不完善。本文选取C合伙企业案和G合伙企业案进行双案例对比分析,从合伙企业征税模式和协定适用规则两方面分析境外合伙企业境内所得相关税收政策的实际适用情况以及案例背后体现的政策现存问题。在理论分析、政策分析和案例分析的基础上,本文借鉴OECD的建议以及美国、德国和加拿大的相关税收政策,针对我国现行政策的问题提出一系列完善建议:一是统一境内外合伙企业的征税模式,调整境外合伙企业适用协定的原则;二是完善境外合伙企业征税模式的相关政策,完善境外合伙企业适用协定的相关政策;三是加强国内相关税收征管,加强税收领域国际合作。