MUC1、MUC4、MUC6、MUC16在肝癌中的表达、临床预后及其突变的研究

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目的探究MUC1、MUC4、MUC6、MUC16在肝癌中的表达和临床预后及其突变的关系方法1.通过Ualcan数据库在线分析关于MUC1、MUC4、MUC6、MUC16在肝癌组织中的表达情况。2.Kaplan-Meier Plotter数据库分析并绘制生存曲线并用Log-rank检验比较MUC1、MUC4、MUC6、MUC16高、低表达组肝癌患者之间的生存预后相关性。3.Meth HC数据库在线分析关于MUC1、MUC4、MUC6、MUC16在肝癌组织与正常肝脏组织中甲基化情况。4.GEPIA数据库在线分析MUC1、MUC4、MUC6、MUC16之间在肝癌组织中表达水平的关系。5.Ualcan数据库进一步在线分析MUC1、MUC4、MUC6、MUC16在肝癌组织中的协同表达。6.c Bioportal数据库在线分析关于MUC1、MUC4、MUC6、MUC16在肝癌患者中的基因突变及其突变对患者的生存预后情况。7.STRING数据库找出与MUC1、MUC4、MUC6、MUC16相互作用的蛋白。结果1.MUC1、MUC6在肝癌组织的m RNA表达水平低于正常肝脏组织(t检验均P<0.05),MUC4、MUC16在肝癌组织的m RNA表达水平高于正常肝脏组织(t检验均P<0.05)。2.MUC1在肝癌中的高表达与肝癌患者的总生存(Overall Survial,OS)(P=0.011)和疾病特异性生存率(disease-specific survival,DSS)(P=0.0091)呈负相关;MUC4在肝癌中的高表达与肝癌患者OS呈负相关(P=0.01);MUC6在肝癌中的高表达与肝癌患者的无进展生存期(progression-free survival,PFS)呈负相关(P=0.038);MUC16在肝癌中的高表达都与肝癌患者OS、DSS、PFS呈正相关,P值分别为(P=3e-04)、(P=9.2e-06)、(P=1.7e-06)。3.MUC1在肝癌组织中的甲基化水平高于正常肝脏组织,但是其差异没有统计学意义;MUC4、MUC6、MUC16在肝癌组织中的甲基化水平显著低于正常肝脏组织,其差异具有统计学意义(P<0.005)。4.对GEPIA数据库分析发现在肝癌组织中MUC1的m RNA表达水平与MUC4、MUC6、MUC16的m RNA表达水平呈正相关,MUC4的m RNA表达水平与MUC6、MUC16的m RNA表达水平呈正相关,MUC6的m RNA表达水平与MUC16的m RNA表达水平呈负相关。5.协同分析表明MUC1、MUC4、MUC6、MUC16分别与TC2N、TSPAN1、CSGALNACT1、STS存在明显的相关性。MUC1多数的变异是扩增突变,MUC4、MUC6和MUC16多数的变异是错义突变。MUC1、MUC4、MUC6、MUC16这四个基因突变与生存预后有关(P=6.732E-3),与此同时,MUC1、MUC4、MUC6、MUC16这四个基因之间具有共现性。6.相互作用的蛋白有MUC5B、MUC5AC、MUC6、MUC7、MUC13、MUC15、GALNT4、MUC1、MUC21、GACNT6、B3GNT5、MUC12、MUC17、MUC20,这些蛋白也积极参与调控网络。结论1.MUC1和MUC6可能抑制肝癌的发生,MUC4和MUC16可能促进肝癌的发生。2.MUC1、MUC4和MUC16与肝癌患者的总生存相关,MUC6则肝癌患者的总生存无关。3.MUC1、MUC4、MUC6、MUC16发生的基因突变参与了肝癌的发生与发展,且发生突变的患者预后更差。4.MUC1、MUC4、MUC6、MUC16在肝癌中的甲基化水平有助于阐明肝癌的发生、发展及预后等一系列问题,为肝癌早期诊断和晚期基因治疗提供新的思路。5.MUC1、MUC4、MUC6、MUC16之间的相关性及与其相互作用的蛋白和协同表达分析有助于为肝癌的治疗提供新的治疗靶点。
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