组蛋白去乙酰化酶9的低表达预示肾透明细胞癌的不良预后并抑制免疫细胞浸润

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目的:肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)是肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)最常见的病理亚型(70%-75%)。手术切除依然是早期ccRCC应用最广泛的治疗手段,但是对晚期转移ccRCC效果不佳。研究发现,ccRCC具有高度的免疫原性和治疗抗性。因此,寻找ccRCC中新的分子标志物作为药物靶点同时联合免疫疗法可能会为ccRCC提供一种新的治疗方案。当前,组蛋白去乙酰化已被证实是一种重要的表观遗传修饰方式。组蛋白去乙酰化酶9(histone deacetylase 9,HDAC9)为组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylases,HDACs)的IIa亚型,参与调节众多生物学功能,并在肿瘤中起双重作用。在本次研究中,我们的目的是评估HDAC9在ccRCC中的表达水平,研究ccRCC患者与HDAC9的预后之间的相关性,并进一步探索HDAC9与免疫学参数之间的关联。研究方案:1.通过实时荧光定量多聚核苷酸链式反应(reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)、western blotting和免疫组化检测HDAC9在ccRCC组织和相应正常组织中的表达。利用UCSC Xena数据库评估HDAC9表达与总生存期(overall survival,OS)之间的关系。2.利用HDAC9过表达质粒和阴性对照构建稳转细胞系。通过克隆形成、5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷(5-ethynyl-2’-deoxyuridine,EdU)细胞增殖实验、transwell实验研究HDAC9过表达对肾透明细胞癌细胞系786-O和ACHN的增殖、迁移和侵袭能力的影响。3.利用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)探索HDAC9在ccRCC中潜在的生物学功能。4.使用肿瘤免疫分析(Tumor IMmune Estimation Resource,TIMER)数据库评估HDAC9基因表达与免疫学相关参数之间的关系。研究结果:1.本次研究中,RT-qPCR、western blotting和免疫组化的结果一致确认HDAC9在ccRCC中相对正常组织为低表达。低HDAC9表达与不良预后密切相关。2.克隆形成和EdU结果显示,HDAC9过表达显著抑制了786-O和ACHN细胞的增殖。而transwell实验发现HDAC9表达升高显著抑制了786-O和ACHN细胞的迁移和侵袭3.GSEA结果提示众多免疫和炎症相关的通路与HDAC9的表达呈明显的正相关。4.B细胞、CD8~+T细胞、CD4~+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞的浸润水平均与HDAC9表达明显正相关。同时,HDAC9表达也与多个常见免疫检查点的表达正相关。结论:在ccRCC中,HDAC9表达降低并与不良预后关系密切。高表达HDAC9限制了ccRCC细胞的增殖、迁移和侵袭,但同时激活了免疫细胞浸润。因此,HDAC9可作为一个ccRCC新的治疗靶点,但需要更为深入的研究进行探索。
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