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开口箭(Tupistra chinensis Baker)为百合科开口箭属植物,别名竹根七、岩七[1]。主要分布于中国的南方,如湖北、湖南、福建、江西、浙江、河南、安徽、陕西(秦岭以南)、四川等地,生林下荫湿处、溪边或路旁,海拔1000-2000米。开口箭醇提取物内含有大量的甾体皂苷和皂苷元等有效化学成分,并且毒副作用极小,具有很大的药用价值。开口箭是一种疗效很好的药材资源,目前得到广泛的关注,但由于环境破坏和过度采挖的影响,野生开口箭的数量正急剧减少,导致了该种质资源的枯竭。因此,应采取紧急措施,保护和恢复这一宝贵的自然资源。(1)微卫星引物的开发;本研究基于第二代测序建立了开口箭的基因文库,筛选出微卫星区段并设计31对引物,而且对这些引物进行扩增和检测,最终筛选出13对条带清晰、多态性高的引物。同时,以湖北、陕西、云南长柱开口箭(Tupistra grandistigma)、筒花开口箭(Tupistra delavay)、弯蕊开口箭(Tupistra wattii)、剑叶开口箭(Tupistra ensifolia)、吉祥草(Reineckia carnea)、万年青(Rohdea japonica)6个自然种群共27个个体为试验材料,检测该批引物在其近缘种间的通用性。结果表明:在长柱开口箭种群中,13对引物均能检测出等位基因,引物通用率为100%。在弯蕊、剑叶、筒花开口箭种群中有12对引物可以检测出等位基因,引物通用率为92.3%。在吉祥草和万年青种群中有9对引物可以检测出等位基因,引物通用率为69.2%。(2)遗传多样性分析;本研究以5个种群的开口箭干燥叶片为实验材料,提取基因组DNA,扩增、电泳并用软件分析得出以下结论,开口箭在物种水平上的遗传多样性丰富,(NA)为4.5385,(HO)为0.4228,(I)为0.5922。遗传分化显著(GST)为0.3152。(3)克隆多样性分析;本文以4个种群开口箭干燥叶片为实验材料,利用微卫星DNA分子标记(SSR)技术对开口箭的克隆结构、空间遗传结构以及克隆多样性进行了初步研究。实验得出:在种群水平上,敦敦石(NC=2.000,PD=0.500,H=2.300,D=0.970,E=0.836)、天星亮(NC=1.372,PD=0.729,H=3.359,D=0.957,E=0.920),小干河(NC=1.125,PD=0.889,H=3.860,D=0.950,E=0.955)和干河子(NC=1.181,PD=0.847,H=3.831,D=0.956,E=0.954)。四个种群平均克隆大小NC值平均为1.420,基因型比率PD值平均为0.730,香农-威纳指数H平均为3.338,Simpson指数D平均为0.958,克隆基因型均匀性指数E平均为0.916。在物种水平上,克隆大小NC值为2.639,基因型比率PD值为0.379,香农-威纳指数H为5.416,Simpson指数D为0.987,克隆基因型均匀性指数E为0.982。空间自相关性分析显示出,墩墩石(DDS)个体在所有空间距离等级中均不存在明显的空间遗传结构,天星亮(TXL)个体在2.7m时存在显著性正相关,小干河(XGH)个体在1.8m时存在显著性正相关,在8.2m-10.3m之间存在显著的负空间遗传结构,干河子(GHZ)个体在2.1m时存在显著性正相关,在3.1m-5.4m之间存在显著的负空间遗传结构。四个种群的空间自相关系数(r)分别为0.049、0.059、0.060和0.052。本研究也揭示出开口箭种群的克隆空间分布格局与各种群所处生境的生态因子(海拔、光照、湿度、养分等)有关。开口箭在物种水平上的遗传多样性丰富,遗传分化较显著并具有较高的克隆多样性,在保护策略方面建议以就地保护为主、人工繁育等策略。