目的：粘膜相关淋巴组织淋巴瘤(简称MALT淋巴瘤)是发病率仅次于弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡性淋巴瘤的非霍奇金B细胞淋巴瘤。病因学研究证实其发病与感染引起的慢性炎症或自身免疫性疾病密切相关。肿瘤细胞在组织学上呈现小淋巴细胞形态,缺乏典型的形态学特征和特异性免疫组化表型,目前以排除性诊断为主要鉴别方法；而形态学上介于重度炎症与早期MALT淋巴瘤之间的病例,更是临床病理诊断工作中的难点。由于MALT淋巴瘤本身存在免疫球蛋白基因克隆性重排及特有的遗传学异常,包括t(11；18)(q21；q21)、t(1；14)(p22；q32)、t(14；18)(q32；q21)等,通过分子病理学技术进行检测,不仅能够辅助这一类型淋巴瘤的诊断,而且是临床治疗方案选择的主要依据,从而改变以往对于MALT淋巴瘤存在盲目过度治疗的状态。因此,本研究以不同部位原发的MALT淋巴瘤病例为研究对象,拟在FFPET上建立稳定的检测IGH基因重排的PCR技术和染色体易位的荧光原位技术,一方面用于MALT淋巴瘤的诊断及鉴别诊断,另一方面为临床合理治疗及判断预后提供科学的依据。方法：选择94例MALT淋巴瘤,4例淋巴组织增生性病变及10例重度胃炎病例。第一部分：应用BIOMED-2标准化引物体系检测58例,包括44例MALT淋巴瘤、4例淋巴组织反应性增生性病变和10例重度慢性炎症病例IGH基因克隆性重排；从而评估该方法在MALT淋巴瘤的诊断和鉴别诊断中的应用价值；第二部分：应用荧光原位杂交技术(FISH)在FFPET上检测45例不同部位原发的MALT淋巴瘤染色体易位t(11；18)(q21；q21)和t(14；18)(q32；q21)；通过免疫组织化学方法,观察MALT1和BCL10两个蛋白在MALT淋巴瘤组织中的表达,分析MALT1的表达水平及BCL10在细胞内定位表达与特异性染色体易位之间的相关性,并结合临床病史及随访资料,总结不同部位原发MALT淋巴瘤的临床病理特征及预后相关因素。结果：1、本研究58例样本,经DNA质控引物检测后可用于模板扩增的37例(包括23例MALT淋巴瘤,4例淋巴组织反应性增生和10例重度胃炎),18例MALT淋巴瘤和2例反应增生性病变检测到IGH单克隆重排,敏感性为78.3%(18/23),10例重度炎症和2例反应性增生病变均未检测出IGH基因呈单克隆性重排,特异性为85.7%(12/14)。VH-FR1、VH-FR2、VH-FR33个引物管组合应用对IGH单克隆性重排的检出率明显高于单独及任意两个引物管组合(P＞0.05)。2、45例石蜡包埋组织样品经FISH检测(包括41例MALT淋巴瘤,1例DLBCL,1例B细胞来源的非霍奇金淋巴瘤,2例淋巴组织增生)均获得满意的信号。6例MALT淋巴瘤(胃和肺各3例)MALT1基因断裂(14.6%,6/41),3例t(11;18)(q21；q21)阳性(14.3%,3/21)；5例MALT淋巴瘤(4例肠道和1例眼附属器)检出18号染色体非整倍体(45.5%,5/11)；1例甲状腺原发MALT淋巴瘤IGH和MALT1基因拷贝数增加,但未检测出t(14；18)(q32；q21)；1例甲状腺和1例乳腺MALT淋巴瘤检测出IGH基因断裂,但未发生t(14；18)(q32；q21)。3、92例MALT淋巴瘤免疫组化染色检测MALT1和BCL10的表达,18例表现为MALT1蛋白强表达,29例表现为中等强度的胞浆表达,46例(50.0%)呈现弱阳性或阴性表达；40例(43.5%)BCL10染色细胞浆和细胞核同时表达,32例呈现细胞核阳性,15例呈现胞浆阳性,另有5例不表达BCL10抗体。MALT1的表达在染色体异常组与正常组中存在差别(P＜0.05),即MALT1蛋白在染色体异常的MALT淋巴瘤病例组中的表达水平高于染色体异常组；而BCL10的表达模式在两组间无差别(P＞0.05)。4、87例临床随访资料完整的MALT淋巴瘤按照Ann-Arbor I临床分期：ⅠE期57例,ⅡE期18例,ⅢE期1例,ⅣE期11例。ⅠE期和ⅡE期5年生存率分别为89.4%和81.4%,ⅢE、ⅣE期5年生存率为61.1%。临床分期、胃肠道原发肿瘤侵犯的深度、治疗方案、是否累及淋巴结外其他器官以及IPI评分是影响患者生存率的主要因素(P<0.05)。结论：在石蜡包埋组织上,IGH基因克隆性重排检测和荧光原位杂交技术均可用来辅助MALT淋巴瘤的诊断及鉴别诊断。PCR方法在鉴别早期MALT淋巴瘤和反应性病变中较FISH技术灵敏度更高,但FISH检测出染色体异常的阳性结果特异性较强,对于辅助诊断和指导治疗有很高的实用价值；染色体易位发生的频率可能限制了FISH技术的灵敏度。MALT1和BCL10抗体可用于MALT淋巴瘤染色体易位诊断的初步筛查。MALT淋巴瘤是一类具有惰性临床过程的低级别B细胞淋巴瘤,患者的长期生存率很高,且预后较好。