卵形鲳鲹JAK家族基因的克隆与表达分析

来源 :广西大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:minifeng
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
Janus激酶(Janus kinase,JAK)是一类非受体酪氨酸蛋白激酶,参与细胞因子的信号传递,可促进细胞增殖、分化、迁移和凋亡,与造血、免疫和形成脂肪等过程密切相关。但卵形鲳鲹JAK还未见报道。本研究应用RT-PCR和RACE技术,获得卵形鲳鲹JAK家族的TraJAK1、TraJAK2、TraJAK3和Tra TYK2的c DNA,应用生物信息学分析JAK家族基因的序列特征、蛋白结构、同源性及构建N-J树;应用q PCR检测健康鱼体中不同组织的表达模式,探讨在刺激条件下JAK家族基因在不同组织中的表达变化与LPS、poly I:C和溶藻弧菌引起反应的关联性;构建p ET-32a-TraJAK3原核重组载体,纯化到高纯度的融合蛋白。现将主要研究成果简述如下:1、TraJAK1、TraJAK2、TraJAK3和Tra TYK2的全长c DNA分别为4998bp、4332 bp、3933 bp和4179 bp;ORF分别为3531 bp、3402 bp、3336 bp和3510 bp,分别编码的氨基酸个数为1176、1133、1111和1169。蛋白结构域预测结果显示其4个蛋白均具有FERM结构域、SH2结构域和2个激酶结构域。同源性分析显示,上述4个蛋白与鱼类JAK家族蛋白的同源性最高,分别为73.8-93.3%、81.4-94.3%、65.0-94.1%和69.5-90.6%。N-J树分析显示,上述4个蛋白分别与鱼类的相应蛋白聚为一支,并与高体魳亲缘关系最近。表明TraJAKs与鱼类的亲缘关系最近,并在硬骨鱼进化过程中较为保守。2、检测健康卵形鲳鲹中上述4个基因的表达分布,结果表明,在各组织(脾脏、脑、鳃、头肾、心脏、肠、肝脏、皮肤和肌肉)中均有表达,但表达水平各不相同。TraJAK1、TraJAK2和Tra TYK2在肝脏表达量最高,TraJAK3在脾脏中表达量最高,且均在肌肉组织表达量最低,表明TraJAKs在鱼体的各种稳态过程中发挥作用。3、LPS刺激后,在头肾、脾脏、肝脏和鳃组织中TraJAK1、TraJAK2、TraJAK3和Tra TYK2基因m RNA的表达量均显著上调,而在肌肉组织中的表达量并无明显变化。在头肾、脾脏和肝脏组织中,TraJAK1在刺激后6 h和12 h的表达量显著上调,而在鳃组织中的表达量在刺激后6 h显著上调,其余时间点虽上升但不显著。在头肾和鳃组织中,TraJAK2在刺激6 h和12h的表达量显著上升,在脾脏和肝脏组织中,TraJAK2在刺激6 h、12 h和24 h的表达量显著上升,均在刺激后48 h下调至不显著。在头肾和脾脏组织中,TraJAK3在刺激后6 h和12 h的表达量显著上升,在肝组织中,TraJAK3在刺激后6 h、12 h和24 h的表达量显著上升,在鳃组织中,TraJAK3在刺激后12 h和24 h的表达量显著上升。在头肾组织中,Tra TYK2在刺激后6 h、12 h和24 h的表达量显著上调,在脾脏组织中,Tra TYK2在刺激后6 h、12h和48 h的表达量显著上调,在肝脏和鳃组织中,Tra TYK2在刺激后6 h和12 h的表达量显著上调,其余时间点表达量上升但不显著。poly I:C刺激后,TraJAK1在头肾、脾脏、肝脏和鳃组织中表达量均显著上调,分别在48 h、48 h、6 h和12 h达到峰值。TraJAK2在刺激第6 h和48 h的脾脏和鳃组织中的表达量显著上升,而在头肾和肝脏组织中,TraJAK2在刺激6h、24 h和48 h的表达量显著上调。TraJAK3 m RNA在头肾、脾脏和肝脏组织中在刺激后6 h的表达量显著上升,分别在48 h、24 h和48 h时间点达到表达量的峰值,TraJAK3在刺激24 h时间点的鳃组织中表达量显著上调,并在48 h达到峰值。Tra TYK2在刺激后6 h的头肾、脾脏、肝脏和鳃组织中的表达量显著上调,在刺激后12 h的脾脏、肝脏组织中表达量和在刺激后24 h的头肾组织表达量均显著上升,且均在刺激48 h后达到峰值。以上4个基因在肌肉组织中表达量均无显著变化。溶藻弧菌刺激后,在头肾组织中TraJAK1 m RNA在刺激后12 h的表达量显著上调,在脾脏组织中TraJAK1 m RNA在刺激后6 h和12 h的表达量显著上升,在肝脏组织中TraJAK1 m RNA在刺激后24 h和48 h的表达量显著上调,在鳃组织中TraJAK1 m RNA在刺激后48 h的表达量显著上升。TraJAK2 m RNA在刺激后6 h和12 h的头肾、脾脏和鳃组织中的表达量显著上调,在刺激后6 h的肝脏组织中的表达量显著上调。在头肾、脾脏和鳃组织中TraJAK3在刺激12 h和24 h后的表达量显著上升,在肝脏组织中TraJAK3在刺激24 h和48 h后的表达量上调。头肾、脾脏、肝脏和鳃组织中Tra TYK2在刺激后6 h和48 h时间点的表达量均显著上调。上述4个基因在刺激后的肌肉组织表达量并无显著变化。以上结果表明,TraJAKs基因可能参与机体抵御细菌、病毒入侵等相关免疫反应。4、将TraJAK3 ORF克隆至原核表达载体p ET-32a中,构建原核表达载体p ET-32a-TraJAK3,经IPTG诱导表达,重组蛋白以包涵体形式大量表达,并纯化得到高纯度的融合蛋白,为TraJAKs功能研究提供理论基础,也为了解TraJAK3蛋白结构和相互作用提供科学依据。
其他文献
专利制度是指对公开技术的发明者进行补偿,允许其在一段时间内对此发明保有独占权。专利的存续期是从申请之日起的20年时间。专利制度严格禁止不向发明者支付专利使用费用而
张量特征值互补问题是基于互补问题和张量特征值问题的一类特殊互补问题。随着互补问题和张量特征值问题的不断发展和广泛应用,张量特征值互补问题也取得较大的发展。本文主
海洋生物污损是指海洋中的微生物或动植物在海洋设施(如船舶、混凝土桥墩和输油管道等)表面附着、生长及积累的过程。其不仅严重制约着人们对海洋资源的开发利用,甚至还会导致
近年来,随着古城文化研究的深入,古城旅游热度越来越高,古城文化旅游开发项目也越来越多。古城文化旅游开发的快速发展不仅带动了当地的经济发展,还将古城当地的特色文化加以传承和发展,受到了当地政府和人民的高度关注。在发展过程中,如何处理好遗产保护和古城文化旅游开发之间的关系是一项重大课题。平遥古城在文化旅游开发过程中也呈现出一系列问题,主要表现为:旅游经济效益较低、旅游开发不合理、旅游基础设施投入较少、
学位
随着制造技术的飞速发展,微流控设备的应用越来越广泛。整个系统可集成在厘米级甚至微米级尺度的芯片上,在这个尺度下,表面粗糙度的影响是不可绕开的一个难题。由于加工精度
随着信息技术的飞速发展以及企业信息化水平的不断提高,企业办公业务数量与类型的不断增加以及流程的越来越复杂,对办公自动化系统的运行效率、健壮性等都提出了更好的要求。办公自动化系统由于一定会涉及工作流的问题,为了满足业务需求,该领域出现了很多的工作流框架,如JBPM、OSWork Flow、Shark以及Activiti等。这些为开发出一个更加高效、健壮的办公自动化系统提供了很大的支持与保障。但是也伴
甘蔗(Saccharum spp.L.)是广泛种植于热带及亚热带地区的多年生禾本科植物,是世界第一大糖料作物。由革兰氏阳性细菌Leifsonia xyli subsp.xyli(Lxx)引起的甘蔗宿根矮化病(Ra
DSP(Demand Side Platform)即需求方平台,在互联网广告中有着重要的作用,它通过对接若干个广告交易平台,让广告主合理精准的投放广告。不同于传统的广告方式,DSP并不专门购买媒体流量资源,而是通过AD Exchange(广告交易平台),采用实时竞价的方式赢得广告展示的机会。AD Exchange发送广告请求给DSP,DSP接收到请求并决定是否进行投放以及投放什么类型的广告,AD
目的研究奥拉帕利(Olaparib)在维持治疗晚期卵巢癌患者中的有效性和安全性。方法:回顾性分析2018年9月1日至2020年2月29日在福建省来自11家医院使用Olaparib维持治疗的晚期卵巢癌患者数据。根据RECIST1.1标准评估患者对奥拉帕利治疗的反应。采用Kaplan-Meier方法估算无进展生存期(Progression Free Survival,PFS)以及与治疗相关的不良事件发
母猪繁殖性能的高低与养殖场的生产效益紧密相关,提高母猪健康水平,改善母猪繁殖性能具有重要意义。近年来膳食纤维(dietary fiber,DF)对母猪繁殖性能的影响报道较多,但DF对