miR-30e-5p靶向SNAI1调控EMT对胰腺癌的影响及机制研究

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yy136301854
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
第一部分miR-30e-5p在胰腺癌组织中的表达及与胰腺癌临床病理特征的关系目的:探讨miR-30e-5p在胰腺癌组织的表达情况及与胰腺癌临床病理特征的关系。方法:收集2016年7月至2019年8月期间在广西医科大学第一附属医院住院的48例配对胰腺癌及其癌旁胰腺组织,所有患者均经病理确诊为胰腺癌。采用miRNeasy FFPE试剂盒提取RNA,q RT-PCR检测胰腺癌组及癌旁组中miR-30e-5p的表达水平。采用Pearson相关分析法对miR-30e-5p的表达水平与胰腺癌患者的年龄、性别和TNM分期进行临床相关分析。结果:(1)胰腺癌组患者组织中miR-30e-5p的基因表达水平低于癌旁组(P<0.01),差异有统计学意义。(2)miR-30e-5p表达水平在患者不同性别、年龄和TMN分期比较差异均未达到统计学显著性。结论:miR-30e-5p在胰腺癌及其癌旁组织中显著差异表达,提示miR-30e-5p可能在胰腺癌的发生发展发挥重要作用。第二部分miR-30e-5p在体外对胰腺癌细胞生物学功能的影响目的:通过在人胰腺癌细胞株转染miR-30e-5p进行体外细胞实验,探讨miR-30e-5p对人胰腺癌细胞生物学功能的影响。方法:采用脂质体法在人胰腺癌细胞株Bx PC-3和PANC-1细胞转染阴性对照(negative control,NC)、miR-30e-5p mimics和miR-30e-5p inhibitor,将转染后的细胞分为NC组、miR-30e-5p mimics组和miR-30e-5p inhibitor组。q RT-PCR法检测Bx PC-3和PANC-1细胞各组的miR-30e-5p表达;MTT法检测Bx PC-3和PANC-1细胞各组的细胞活力;细胞克隆形成实验检测Bx PC-3和PANC-1细胞各组的集落形成能力;细胞侵袭实验(Transwell法)检测Bx PC-3和PANC-1细胞各组的侵袭能力;细胞迁移实验检测Bx PC-3和PANC-1细胞各组的迁移能力;流式细胞术检测Bx PC-3和PANC-1细胞各组的凋亡率;流式细胞术检测Bx PC-3和PANC-1细胞各组的细胞周期。结果:(1)q RT-PCR实验发现,在Bx PC-3和PANC-1细胞中,miR-30e-5p mimics组的miR-30e-5p的基因表达水平较NC组明显上升,差异均有统计学意义(P<0.001)。(2)MTT实验发现,与NC组相比,miR-30e-5p mimics组均能抑制Bx PC-3和PANC-1细胞的细胞活力,差异均具有显著性(P<0.05);miR-30e-5p inhibitor组均能增加Bx PC-3和PANC-1的细胞活力,差异均具有显著性(P<0.05)。(3)细胞克隆形成实验发现,与NC组相比,miR-30e-5p mimics组均能抑制Bx PC-3和PANC-1细胞的集落形成能力,差异均有统计学意义(P<0.001);miR-30e-5p inhibitor组均能促进Bx PC-3和PANC-1细胞的集落形成能力,差异均有统计学意义(P<0.001)。(4)细胞侵袭实验显示,与NC组相比,miR-30e-5p mimics组均能抑制Bx PC-3和PANC-1细胞的侵袭能力,差异均有统计学意义(P<0.01);miR-30e-5p inhibitor组均能促进Bx PC-3和PANC-1细胞的侵袭能力,差异均有统计学意义(P<0.05)。(5)细胞迁移实验显示,与NC组相比,miR-30e-5p mimics组均能抑制Bx PC-3和PANC-1细胞的迁移能力,差异均有统计学意义(P<0.01);miR-30e-5p inhibitor组均能促进Bx PC-3和PANC-1细胞的迁移能力,差异均有统计学意义(P<0.05)。(6)细胞凋亡实验显示,与NC组相比,miR-30e-5p mimics组均能促进Bx PC-3和PANC-1细胞凋亡,差异均有统计学意义(P<0.01);miR-30e-5p inhibitor组能抑制Bx PC-3和PANC-1细胞凋亡,差异均有统计学意义(P<0.05)。(7)细胞周期实验发现,与NC组相比,miR-30e-5p mimics组和miR-30e-5p inhibitor组均未能干预Bx PC-3和PANC-1的各期细胞周期。结论:胰腺癌中高表达的miR-30e-5p能够显著抑制胰腺癌细胞的增殖、侵袭、迁移和促进凋亡,提示miR-30e-5p在胰腺癌发生发展过程中可能发挥着抑癌作用。第三部分miR-30e-5p及其潜在靶基因SNAI1的关系研究目的:通过miRNA数据库预测miR-30e-5p潜在靶基因SNAI1和结合位点,并通过双荧光素酶和q RT-PCR验证是否能与SNAI1位点结合。方法:通过Target Scan网站预测miR-30e-5p靶基因SNAI1及其结合位点,通过构建SNAI1的WT和MUT载体转染393T细胞,将细胞分为WT+NC组、WT+miR-30e-5p mimics组、MUT+NC组和MUT+miR-30e-5p mimics组,通过PCR验证是否能与SNAI1位点结合。采用q RT-PCR法检测转染NC、miR-30e-5p mimics和miR-30e-5p inhibitor后Bx PC-3和PANC-1细胞各组SNAI1的表达水平。结果:(1)通过miRNA靶基因预测网站查询到miR-30e-5p与SNAI1有结合位点。(2)双荧光素酶的报告发现,WT+miR-30e-5p mimics组的相对荧光素酶读数较WT+NC组显著性下调((P<0.01));而MUT+NC组和MUT+miR-30e-5p mimics组之间无显著性差异。(3)q RT-PCR实验发现,与NC组相比,在Bx PC-3和PANC-1细胞中,SNAI1基因的表达水平在miR-30e-5p mimics组均下降,均有显著差异性(P<0.001);反之,SNAI1基因的表达水平在miR-30e-5p inhibitor组均上升,均有差异性(P<0.05)。结论:miR-30e-5p可能通过影响靶基因SNAI1的翻译进而减少蛋白质表达参与胰腺癌的发病机制。第四部分miR-30e-5p表达对胰腺癌细胞转录组的影响目的:探讨miR-30e-5p在胰腺癌细胞中可能调控的基因,阐明其在胰腺癌发生、发展过程中的可能机制。方法:通过脂质体转染法在PNAC-1细胞转染NC、miR-30e-5p mimics和miR-30e-5p inhibitor,分为NC、mimics和inhibitor 3个组。通过转录组测序技术检测细胞3个组的基因表达谱,通过生物信息学方法比较mimics组VS NC组和inhibitor组VS NC组细胞间的差异表达基因(DEGs)。对mimics组和inhibitor组患者的DEGs行基因本体论(GO)功能富集及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;对mimics组和inhibitor组的DEGs行预后分析;mimics组和inhibitor组利用以NC组作为对照富集到结果行基因集富集分析(GSEA)。结果:(1)转染miR-30e-5p后,mimics组筛选出253个DEGs,inhibitor组筛选出63个DEGs,mimics组DEGs主要富集在双向调控基因的表达和表观遗传、细胞蛋白质代谢过程等,inhibitor组主要富集在核酸的调控、以DNA为模板的转录调控、DNA模板转录等生物学过程。(2)预后分析显示mimics组和inhibitor组的DEGs与胰腺癌患者预后密切相关。(3)GSEA分析显示mimics组GO主要富集在调节炎症反应、调节免疫反应和双向控血管内皮生长因子的产生等。mimics组KEGG可以显著富集在β-catenin、MMP-14、Interleukin-7、NCAM1和COMP等信号通路。结论:miR-30e-5p非常有可能通过EMT影响胰腺癌的发生发展。第五部分miR-30e-5p靶向SNAI1调控EMT对胰腺癌抑癌作用的分子机制的探讨目的:探讨miR-30e-5p靶向SNAI1调控EMT对胰腺癌抑癌作用的分子机制。方法:采用慢病毒感染法在人胰腺癌细胞株Bx PC-3和PANC-1感染过表达SNAI1(OE-SNAI1)慢病毒后,再转染NC、miR-30e-5p mimics和miR-30e-5p inhibitor进行实验,将细胞分为OE-SNAI1+NC组、OE-SNAI1+miR-30e-5p mimics组和OE-SNAI1+miR-30e-5p inhibitor组。MTT法检测Bx PC-3和PANC-1细胞各组的细胞活力;细胞克隆形成实验检测Bx PC-3和PANC-1细胞各组的集落形成能力;细胞侵袭实验(Transwell法)检测Bx PC-3和PANC-1细胞各组的侵袭能力;细胞迁移实验检测Bx PC-3和PANC-1细胞各组的迁移能力;流式细胞术检测Bx PC-3和PANC-1细胞各组的凋亡率;流式细胞术检测Bx PC-3和PANC-1细胞各组的细胞周期;Western blot检测Bx PC-3和PANC-1细胞各组的SNAI1、E-cadherin、N-cadherin和MMP-9等EMT相关蛋白表达。结果:(1)MTT实验结果显示,与OE-SNAI1+NC组相比较,OE-SNAI1+miR-30e-5p mimics组均能抑制Bx PC-3和PANC-1细胞的细胞活力,差异均具有显著性(P<0.05);OE-SNAI1+miR-30e-5p inhibitor组均能增加Bx PC-3和PANC-1的细胞活力,差异均具有显著性(P<0.05)。(2)细胞克隆形成实验显示,与OE-SNAI1+NC组相比,OE-SNAI1+miR-30e-5p mimics组能抑制Bx PC-3和PANC-1细胞的集落形成能力,差异均有统计学意义(P<0.05),OE-SNAI1+miR-30e-5p inhibitor组能促进Bx PC-3和PANC-1的集落形成能力,差异均有统计学意义(P<0.05)。(3)细胞侵袭实验发现,与OE-SNAI1+NC组相比,OE-SNAI1+miR-30e-5p mimics组均能抑制Bx PC-3和PANC-1细胞的侵袭能力,差异均有统计学意义(P<0.05);OE-SNAI1+miR-30e-5p inhibitor组能促进Bx PC-3和PANC-1的侵袭能力,差异均有统计学意义(P<0.05)。(4)细胞迁移实验发现,与OE-SNAI1+NC组相比,OE-SNAI1+miR-30e-5p mimics组能抑制Bx PC-3和PANC-1细胞的迁移能力,差异均有统计学意义(P<0.05);而OE-SNAI1+miR-30e-5p inhibitor组能促进Bx PC-3和PANC-1的迁移能力,差异均有统计学意义(P<0.05)。(5)细胞凋亡实验发现,与OE-SNAI1+NC组相比较,OE-SNAI1+miR-30e-5p mimics组能促进Bx PC-3和PANC-1细胞凋亡,差异有统计学意义(P<0.05);OE-SNAI1+miR-30e-5p inhibitor组对细胞凋亡无影响。(6)细胞周期实验发现,与OE-SNAI1+NC组相比较,OE-SNAI1+miR-30e-5p mimics组在PANC-1细胞G1期比例有所降低(P<0.05),S期的比例升高(P<0.05),余各组对细胞周期G1、S和G2各期无明显影响。(7)Western blot实验发现,与NC组相比,E-cadherin蛋白在Bx PC-3和PANC-1细胞的miR-30e-5p mimics组中表达上调(P<0.001);而在Bx PC-3和PANC-1的miR-30e-5p inhibitor组中表达下调(P<0.05),差异均有统计学意义。N-cadherin蛋白在Bx PC-3细胞的miR-30e-5p mimics组中表达下调(P<0.001);而在Bx PC-3和PANC-1细胞的miR-30e-5p inhibitor组中表达上调(P<0.01),差异均有统计学意义。SNAI1蛋白在Bx PC-3和PANC-1细胞的miR-30e-5p mimics组中表达下降(P<0.05);而在Bx PC-3和PANC-1的miR-30e-5p inhibitor组中表达上调(P<0.01),差异均有统计学意义。MMP-9蛋白在Bx PC-3和PANC-1细胞的miR-30e-5p mimics组中表达下调(P<0.05);在PANC-1细胞的miR-30e-5p inhibitor组中表达上调(P<0.01),差异有统计学意义。结论:miR-30e-5p可能通过miR-30e-5p-SNAI1-EMT调控轴调控胰腺癌细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡等肿瘤生物学行为。
其他文献
第一部分通过生物信息学分析发现Slit2-Robo信号通路可能参与了慢性阻塞性肺疾病的发病过程目的:探索重度慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者与健康吸烟者肺组织转录组之间的差异表达基因并进一步探讨COPD可能的发病机制。方法:通过检索GEO公共数据库获取包含有不伴肺癌的重度COPD患者及健康吸烟者的肺组织转录组表达谱的数据集,分别使用GEO2R在线分析网站进行每个数据集差异表达基因(DEGs)的筛选
目的:探讨miR-1288影响胶质母细胞瘤增殖的分子机制,寻找调控肿瘤细胞的关键蛋白及信号通路;并对miR-1288载体运输可行性进行研究,旨在为GBM的治疗提供新思路和策略为胶质瘤的预防和治疗提供新靶点和研究思路。方法:1.基于高通量的全转录组测序,从mRNA、lncRNA、miRNA和circRNA的角度综合分析miR-1288抑制GBM增殖的具体分子机制。2.基于差异表达的miRNA、lnc
近年来,随着诊断水平的提高,越来越多的气管狭窄患者被发现。其中,损伤性(如气管插管、气管切开后)气管狭窄在临床中尤为常见。损伤性气管狭窄直接影响患者的身体健康和生活质量,严重威胁患者的生命安全,给家庭以及社会造成沉重的负担。因此,进行损伤性气管狭窄作用和调控的研究,具有重要的临床意义。防治损伤性气管狭窄,应重点针对气管狭窄肉芽组织的纤维改变和炎症反应等系列的病理生理改变,采取有效的措施减轻或阻止成
背景重症肌无力(Myasthenia gravis,MG)是一种由抗乙酰胆碱受体(Acetylcholine receptor,ACh R)、肌肉特异性激酶(Muscle-specific kinase,Mu SK)、低密度脂蛋白受体相关蛋白4(Low-density lipoprotein receptor-related protein 4,LRP4)或其他ACh R相关蛋白的抗体介导、T细胞
人内源性逆转录病毒长末端重复序列结合体2(human endogenous retrovirus H long terminal repeat-associating 2,HHLA2),是新发现的一个B7家族成员。HHLA2对于T细胞具有共刺激和共抑制双向调节作用:一方面可以刺激T细胞的增殖和细胞因子的产生,另一方面抑制CD4+和CD8+T细胞的增殖和细胞因子的产生。此外,HHLA2还可促进血管生
第一部分 TRIB1和TRPS1多态性对广西京族和汉族人群血脂水平的影响背景:血脂代谢异常是代谢综合征的重要组成部分,也是动脉粥样硬化性心血管疾病(Atherosclerotic cardiovascular disease,ASCVD)发生和发展的重要危险因素。研究表明,血脂代谢异常如总胆固醇(Total cholesterol,TC)、低密度脂蛋白胆固醇(Low-density lipopro
第一部分 锥光束乳腺CT与MRI、乳腺X线摄影对非肿块强化病变相关指标诊断的一致性分析目的 探讨锥光束乳腺CT(Cone beam breast computed tomography,CBBCT)与MRI对非肿块强化病变(Non-mass enhancement lesions,NMELs)的强化分布类型及内部强化特征,CBBCT与乳腺X线摄影(Digital mammography,DM)对钙
第一部分MCU rs7901016 SNP与血脂水平和缺血性心脑血管疾病的关系背景:冠心病(Coronary heart disease,CHD)和缺血性脑卒中(Ischemic stroke,IS)是导致全球人口死亡和致残的两种主要疾病。遗传因素是CHD和IS的主要危险因素,研究显示父母CHD病史是卒中的危险因素,卒中家族史是CHD的危险因素,这些研究表明这两种疾病具有相似的病理机制和遗传易感性
第一部分内质网应激对ACC细胞生物行为影响的体外研究目的:在体外探讨内质网应激对人肾上腺皮质癌细胞生物学行为的影响。方法:使用内质网应激诱导剂Thapsigargin(TG)干预ACC细胞系(SW-13细胞及NCI-H295R细胞);CCK8法检测两个细胞系的增殖情况;流式细胞仪(FITC/PI法)、Hoechst 33258法、透射电镜检测TG对ACC细胞凋亡的影响;Transwell实验检测T
研究背景及目的:肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC,以下简称肝癌)是原发性肝癌中最多见的一种类型,也是全球范围内最常见的恶性肿瘤之一。肝癌高复发、高转移的特征,使得肝癌成为全球范围内一个重大的医疗负担,而且也是影响治疗效果的主要瓶颈。在肝癌术后复发中,由于早期复发预后更差,因此探寻肝癌术后早期复发患者体内的关键分子,对于肝癌的靶向治疗及预后判断具有举足轻重的价值。环