截止于2016年底，我国新三板上市公司数量已经超过了10000家，成为了我国中小企业，尤其是高新技术企业的重要融资平台，成为了这些企业在主板上市的一个主要跳板。在新三板上市，对于企业而言，不仅增加了一个重要的融资渠道，也为规范企业管理起到了重要的作用。新三板上市公司依照相关规定，应当定期进行财务信息和公司经营信息的披露，并且接受投资者和第三方监管机构的监督。在这一过程中，也就有效地规范了新三板上市公司的经营管理活动，特别是财务管理活动。但是也应当看到，由于新三板上市公司中大部分为中小企业，长期以来在财务管理方面存在着一些不规范的问题，例如缺乏完善的内部控制机制，没有为控制经营风险和财务风险起到应有的作用，这也是当前新三板上市公司在财务风险管理方面存在的一个重要不足。
　　在本文研究中，以汇元科技公司为研究对象，对其内部控制体系情况进行了研究。通过调查，了解汇元科技公司的内部控制体系现状，包括其内部控制部门组织结构、内部控制制度及流程等方面的情况。然后着重分析了汇元科技公司当前在内部控制体系方面存在的一些问题，探究了这些问题的原因。针对这些问题，结合汇元科技公司实际情况，提出了其内部控制体系的优化策略。经过研究发现，汇元科技公司在新三板上市之后，获得了较好的资金支持，发展较为迅速。但是在内部控制体系方面，还缺乏科学的意识，没有建立起完善的内部控制机制，现有的内部控制制度和内控人员素质等方面均存在着一定的不足。因而对其长远健康发展来说，需要建立起完善的内部控制体系，对于当前内部控制体系中存在的一些问题积极进行解决。这对于其财务风险和经营风险的控制，以及经营管理机制的规范都有着十分重要的作用。