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本研究利用11对微卫星标记检验了130只新扬州鸡品种内的等位基因组成，计算了11个微卫星座位的等位基因数、等位基因频率、多态信息含量(PIC)及平均杂合度，结果表明11个微卫星座位的平均等位基因数为4.272个、平均杂合度为0.6034、平均多态信息含量为0.5209。 在本次实验中，产蛋性状、蛋品质指标间存在着显著相关关系，方差检验表明，产蛋性状中初产体重与40周龄平均蛋重间相关系数显著(P＜0.05)；蛋重与蛋黄重、蛋壳重、蛋壳厚度间存在着极显著相关关系(P＜0.01)；强度与比重、蛋壳厚度间存在着正相关，与蛋形指数间存在着显著负相关关系；此外，比重还与蛋壳厚度、哈氏单位存在着极强的正相关；蛋形指数与哈氏单位成正相关关系；蛋黄重还与蛋壳重、蛋壳厚度成正相关关系。 利用11个微卫星引物分析新扬州鸡群体中蛋用性能(产蛋性状、蛋品质性状)。结果表明：在11个微卫星座位中，ADL0166座位上不同基因型对应的平均日产蛋数、蛋形指数的最小二乘均值差异显著(P＜0.05)；ADL0273座位上不同基因型对应40周龄平均蛋重、蛋黄重的最小二乘均值差异显著(P＜0.05)；MCW0085座位上不同基因型对应的蛋形指数和哈氏单位的最小二乘均值差异显著(P＜0.05)；MCW0014座位上不同基因型对应的蛋重和蛋壳重的最小二乘均值差异显著(P＜0.05)；ADL185座位上不同基因型对应的哈氏单位值差异显著(P＜0.05)。 方差检验表明，ADL0166可能与控制初产日龄的QTL相连锁；ADL0273可能与控制40周龄平均蛋重、蛋黄重的QTL相连锁；ADL0085可能与控制蛋形指数、哈氏单位的QTL相连锁；MCW0014则可能与控制蛋重、蛋壳重的QTL相连锁；ADL185可能与控制哈氏单位的QTL相连锁。 高度相关的某些性状在检测的11个微卫星座位上并没有表现出一致性，可能与该11个微卫星座位与控制某些性状的QTL连锁不紧密导致的。