环境公益诉讼在制度上确定了诉讼主体以诉讼手段维护公众权益,通过六年来实施,在保护生态环境和弥补行政行为的工作的不足上取得了不错的社会和法律效果。但是,环境损害行为可能会损害环境公共利益和个人私人利益,使这种诉讼必然存在利益交织的复杂性。不同利益主体带来的环境民事公益诉讼与私人利益诉讼之间的冲突是不可避免的。然而当今的立法和司法解释更多地关注两者之间的差异。虽划分了不同诉讼制度可以避免两者在应用上的混淆,但忽视两者之间的共同运作会带来诸多弊端。当前中国环境民事公益诉讼的相关还有一些规则尚未确立,系统构建还不完善。许多具体措施仍处于实验探索阶段,使得双方在实体和程序运行皆遇到障碍。实体层面,存在着不同诉讼主体间开展权益救济衔接不融洽和诉讼管辖制度不同致若干诉讼结果存在差异。在程序层面,审判机关对环境公益诉讼与私益诉讼的审理顺位未确定、当前我国两种权益诉讼平行双轨制排除了审判机关合并审理之可能等困局,同时存在着利益位阶的冲突与国家补位的缺失致使两者权益未合理保护。当前诉讼的运作过甚于二者的互斥与差异,侧重于单个诉讼的各行其是,而疏漏了环境侵害的整体性与复杂性,尚未剖析此种困境产生原因,也未依照实际场景对诉讼制度与流程进行统筹规划。面对环境侵害,域外多国通过相应的法律制度予以积极应对。在借鉴境外成熟法律制度经验基础上,结合中国国情的环境公益诉讼与环境私益诉讼实际运作中的实际情况,我国环境公益诉讼与私益诉讼协调问题研究完善的路径主要有:在实体层面,以通过环境公益诉讼主体以第三人介入私益诉讼、环保团体与公民共同启动诉讼程序和法院公告制度的运用拓宽不同诉讼主体参与环境权益救济的途径,同时将两种环境权益诉讼进行集中统一地管辖。在程序层面,通过赋予诉讼启动主体申请暂缓审理之权能与适当允许公益诉讼先行审理促成诉讼审理次序上的理顺,遵循意思自治原则一定条件下允许两种诉讼审理程序的合并,在赔偿上两种诉讼的赔偿顺序的厘清与国家责任的补位保证救济实现。