LRR-RLK基因家族进化模式与进化机制的研究

来源 :南京大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangxiaohong75
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
植物抗性育种是植物抵抗病原菌最有效方法之一。RLK基因家族中有不少未被鉴定出的抗病基因。富亮氨酸受体激酶家族(LRR-RLK)是RLK基因家族中的一大亚族。对LRR-RLK基因家族功能和进化模式、机制的研究将对植物抗病基因和其它功能基因合理、高效的利用具有十分重要的意义。本文首次从拟南芥、水稻、葡萄、杨树四个基因组的范围,系统的研究了所有LRR-RLK的遗传变异规律,并利用拟南芥和水稻研究了抗病基因的主要扩张机制串联复制。   我们首先在拟南芥、水稻、葡萄、杨树中分别确定了196、308、266、321个LRR-RLK基因,用已知功能基因为参照进行系统进化树的构建。从系统发生学来看,抗病功能基因和参与发育共生作用的基因有着显著不同的进化模式,抗病基因会在某个或某几个物种中发生特异性扩张,而发育共生作用的基因则基本不发生扩张。根据不同的进化模式我们将树里的LRR-RLK基因分为6个大类并分别计算ka/ks值。得出结论抗病基因所受选择压力大于其它功能基因。我们用管家基因构建树并计算ka/ks做参照,所得到的拓扑结构接近发育功能基因而和抗病基因有显著区别。管家基因和NBS-LRR抗病基因家族的ka/ks值做参照表明LRR-RLK基因的不同进化模式源于其在物种分化后所承担的不同的功能。我们根据进化模式在四物种中未确定功能基因里预测了抗病基因和发育功能基因,它们的各项参数和已知功能基因的相符,推动了根据进化模式预测LRR-RLK基因功能的可靠性。   为了研究LRR-RLK基因的具体遗传进化机制,我们深入地在水稻和拟南芥中进行了研究。根据对重复基因的物理位置分析我们得出串联复制是LRR-RLK基因家族扩张的主要机制。进一步计算水稻LRR-RLK最大分支中基因的Ks、Pi和dA值,结果显示:大约在46-107百万之前,水稻这一支的LRR-RLK基因发生过一次大的扩张事件,而且差异被固定下来,受到了差异性选择的作用。串联复制包括非等位交换和基因转换。本研究的结果对了解抗病基因的进化规律,更好地保存和利用抗病遗传资源将会有重要理论意义。
其他文献
占卜对西夏社会的影响深远,党项人在做事之前都会做一个占卜来卜凶卦吉,乞求得到神灵的指点,星占在一定程度上影响了党项民族的政治走向和军事决策.中原占卜学对党项占卜学影
清末民初一代鸿儒辜鸿铭以其对中国文化的热爱,坚信儒家学说正译可以纠正西方对中国的偏见、造福所有的民族.他大力传播儒家文化,开创了中国人翻译儒学经典的先河.当代著名翻
我国水稻的种植面积占全国粮食作物的1/4,而产量则占一半以上,稻谷的生产对我国粮食单产和安全性影响很大。在植物生长和发育所必须的矿质元素中,氮素是需求量最大并起着制约植
本文主要就清徐方言中的儿尾现象进行探讨,清徐方言中没有儿化现象,只有儿尾,并且儿尾自称音节,记作??,主要是受到儿字读音的影响.
期刊
严复一生著译丰富,主要代表有八大译著.他对近代中国的思想界、翻译界以及教育界贡献殊钜,同时对近代中国的版权事业进步亦有鼎力之功.其译著《群学肄言》开创了出版业内多个
随着科学技术的飞速发展,电子信息对抗也变得越来越复杂。雷达信号处理技术不仅在精确度和实时性方面接受着严峻的考验,在宽带宽、复杂监测环境和多信号处理方面也带来了巨大的
随着微电子工业中器件特征尺寸的不断缩小和栅氧厚度的不断减薄,现有的体硅材料和工艺正接近它们的物理极限。应变Si因为它可以通过提高载流子迁移率而极大的提高器件运行速度
如何在现有探测器基础上提升成像的空间分辨率是一个非常有意义的研究课题。微扫描技术与超分辨率重建技术都能在一定程度上实现这一目标。在红外成像领域,目前微扫描技术多
人类长期且大量的使用药品及个人护理用品(PPCPs),使其持续不断地输入环境,导致它们在环境中的残留浓度日益增加,并对人类和其他生物产生了不良的生态毒理效应。本文以四种典型P
芯片的三维集成是解决传统芯片尺寸按比例缩小瓶颈的最有潜力的方法之一。它通过垂直互连将芯片进行堆叠,主要的互连方式是硅穿孔(Through SiliconVia(TSV))技术,TSV为不同层的