自从我国提出创新驱动发展战略以来,创新型城市建设作为我国区域创新体系的基本组成部分,越来越受到政府、学界和媒体的关注。随着城市发展的变化,城市内部形成主体创新集聚趋势。创新主体关系由原来的单一关系逐渐转变为相互依赖、共同进化的关系,创新格局由单一区域发展逐步转化为创新种群乃至城市创新生态系统的发展,创新型城市发展越来越融入创新生态系统之中。一个国家或地区的城市创新生态系统健康性水平直接影响到该国家或地区的城市创新发展能力,开展城市创新生态系统健康性评价能更好的为日趋复杂的城市发展提供科学、合理的决策。本研究在对城市创新生态系统进行系统分析的基础上,结合城市创新生态系统健康性评价研究成果。通过参考VOR评价模型,从驱动力、组织力、创新资源潜力三个方面构建城市创新生态系统健康性评价指标体系,运用云模型评价方法定量分析了2014-2016年我国10个典型创新型城市的创新生态系统健康性发展水平。结果表明:各城市创新生态系统健康性水平差异明显,相比于组织力和创新资源潜力,驱动力对城市创新生态系统健康性影响更为显著,通过驱动力、组织力和创新资源能力的相互协调可以有效提高城市创新生态系统健康性水平。基于实证分析结果,最后从提高创新驱动能力、加大组织优化与创新资源投入、构建城市开发式合作环境等方面提出促进城市创新生态系统可持续健康发展的建议及对策措施。