HLA-DP/HLA-DQ基因多态性与乙肝病毒感染及进展易感性的关联研究

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乙肝病毒感染及其进展的疾病是常见而且影响重大的感染性疾病之一,目前全球约2亿4千万人群为慢性乙肝病毒感染,目前中国不少地区仍为乙肝高流行区,每年因乙肝感染病情加重死亡的患者多达5万人。影响乙肝病毒感染因素中,宿主遗传特性被发现对乙肝病毒感染及进展有重要影响。近年来发表的几个全基因组关联研究发现了位于6号染色体HLA基因家族上的单核苷酸多态性位点(SN P)与乙肝病毒感染及感染后疾病进展密切相关。HLA基因家族富集了多个免疫相关蛋白的编码区,我们将通过对这一区域(主要是HLA-DP/DQ基因簇)的精细定位来发现更多的影响乙肝病毒感染的基因位点,研究这些位点的作用模式、相互影响以及对感染后疾病进展的影响。方法:我们在本研究中收集了1440例健康入和1648例乙肝感染者的样本,分别提取DNA后使用zju-iselect定制芯片对HLA基因区域进行了高密度的SNP位点基因分型精细定位。之后对芯片数据结果分别用PLINK软件和Haploview软件做单个SNP位点和各连锁区块(linkage block, LD)上单倍型的关联分析以及条件关联分析,另外还使用R语言程序包haplo.stat s作单倍型结果的校正。同时通过将病例组对照组分为亚组,我们还做了亚组之间比较分析。结果:本次研究发现所研究的SNP中有76个SNP(位于HLA-DP/DQ基因簇)与乙肝病毒感染显著相关,这些SNP所构成的5个连锁区块也经分析发现与感染显著相关,其中位于HLA-DPB1的SNP位点rs9277535,P值达到3.88 x 10-18进一步条件关联分析发现了基因簇HLA-DP、HLA-DQ与疾病的关联性之间是相互独立的,而在这两个基因簇内部各连锁区块之间则存在相互影响,其中HLA-DPB1 3’-UT R区的SNP (LD block 5)对 HLA-DP与疾病的关联性起到主要作用。另外我们还通过比较乙肝病毒携带者和慢性乙肝患者,慢性乙肝患者和肝硬化患者对疾病组进行了亚组分析,未发现HLA区块存在与疾病进展显著相关的SNP位点。同时我们进行了疾病组亚组与病毒清除亚组比较分析,发现HLA-DPB13’-UTR区的SNP在这一分析中与感染仍然显著相关.结论:我们发现了HLA基因上新的与乙肝感染相关的易感位点,并首次发现基因簇HLA-DP和HAL-DQ对乙肝病毒感染的影响是相互独立的,而HLA-DPB1的3’-UTR区上的SNP位点可能在HLA-DP基因与疾病相关上起主要影响。
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